Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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