Protein–RNA interactions for Protein: A6NF36

CCDC182, Coiled-coil domain-containing protein 182, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC182A6NF36 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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CCDC182A6NF36 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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CCDC182A6NF36 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CCDC182A6NF36 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
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