Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WSZ3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087WSZ3 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
A0A087WSZ3 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
A0A087WSZ3 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
A0A087WSZ3 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
A0A087WSZ3 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
A0A087WSZ3 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
A0A087WSZ3 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
A0A087WSZ3 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
A0A087WSZ3 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
A0A087WSZ3 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
A0A087WSZ3 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
A0A087WSZ3 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
A0A087WSZ3 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
A0A087WSZ3 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
A0A087WSZ3 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
A0A087WSZ3 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
A0A087WSZ3 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
A0A087WSZ3 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
A0A087WSZ3 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
A0A087WSZ3 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
A0A087WSZ3 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
A0A087WSZ3 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
A0A087WSZ3 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
A0A087WSZ3 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
A0A087WSZ3 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
A0A087WSZ3 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
A0A087WSZ3 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
A0A087WSZ3 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
A0A087WSZ3 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
A0A087WSZ3 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
A0A087WSZ3 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
A0A087WSZ3 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
A0A087WSZ3 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
A0A087WSZ3 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
A0A087WSZ3 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
A0A087WSZ3 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
A0A087WSZ3 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
A0A087WSZ3 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
A0A087WSZ3 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
A0A087WSZ3 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
A0A087WSZ3 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
A0A087WSZ3 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
A0A087WSZ3 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
A0A087WSZ3 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
A0A087WSZ3 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
A0A087WSZ3 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
A0A087WSZ3 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
A0A087WSZ3 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
A0A087WSZ3 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
A0A087WSZ3 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
A0A087WSZ3 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
A0A087WSZ3 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
A0A087WSZ3 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
A0A087WSZ3 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
A0A087WSZ3 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
A0A087WSZ3 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
A0A087WSZ3 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
A0A087WSZ3 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
A0A087WSZ3 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
A0A087WSZ3 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
A0A087WSZ3 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
A0A087WSZ3 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
A0A087WSZ3 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
A0A087WSZ3 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
A0A087WSZ3 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
A0A087WSZ3 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
A0A087WSZ3 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
A0A087WSZ3 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
A0A087WSZ3 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
A0A087WSZ3 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
A0A087WSZ3 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
A0A087WSZ3 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
A0A087WSZ3 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
A0A087WSZ3 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
A0A087WSZ3 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
A0A087WSZ3 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
A0A087WSZ3 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
A0A087WSZ3 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
A0A087WSZ3 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
A0A087WSZ3 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
A0A087WSZ3 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
A0A087WSZ3 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
A0A087WSZ3 POU2F2-202ENST00000389341 6901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
A0A087WSZ3 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
A0A087WSZ3 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
A0A087WSZ3 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
A0A087WSZ3 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
A0A087WSZ3 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
A0A087WSZ3 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
A0A087WSZ3 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
A0A087WSZ3 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
A0A087WSZ3 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
A0A087WSZ3 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
A0A087WSZ3 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
A0A087WSZ3 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
A0A087WSZ3 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
A0A087WSZ3 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
A0A087WSZ3 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
A0A087WSZ3 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
A0A087WSZ3 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms