Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARL2-SNX15V9GYD0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARL2-SNX15V9GYD0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARL2-SNX15V9GYD0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARL2-SNX15V9GYD0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARL2-SNX15V9GYD0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARL2-SNX15V9GYD0 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARL2-SNX15V9GYD0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ARL2-SNX15V9GYD0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARL2-SNX15V9GYD0 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARL2-SNX15V9GYD0 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARL2-SNX15V9GYD0 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARL2-SNX15V9GYD0 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARL2-SNX15V9GYD0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARL2-SNX15V9GYD0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARL2-SNX15V9GYD0 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARL2-SNX15V9GYD0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARL2-SNX15V9GYD0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARL2-SNX15V9GYD0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARL2-SNX15V9GYD0 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARL2-SNX15V9GYD0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARL2-SNX15V9GYD0 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARL2-SNX15V9GYD0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARL2-SNX15V9GYD0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARL2-SNX15V9GYD0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ARL2-SNX15V9GYD0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARL2-SNX15V9GYD0 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARL2-SNX15V9GYD0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARL2-SNX15V9GYD0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARL2-SNX15V9GYD0 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARL2-SNX15V9GYD0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ARL2-SNX15V9GYD0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ARL2-SNX15V9GYD0 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
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