Protein–RNA interactions for Protein: U3KQV3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQV3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
U3KQV3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
U3KQV3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
U3KQV3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
U3KQV3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
U3KQV3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
U3KQV3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
U3KQV3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
U3KQV3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
U3KQV3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
U3KQV3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
U3KQV3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
U3KQV3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
U3KQV3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
U3KQV3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
U3KQV3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
U3KQV3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
U3KQV3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
U3KQV3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
U3KQV3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
U3KQV3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
U3KQV3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
U3KQV3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
U3KQV3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
U3KQV3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
U3KQV3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
U3KQV3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
U3KQV3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
U3KQV3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
U3KQV3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
U3KQV3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
U3KQV3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
U3KQV3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
U3KQV3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
U3KQV3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
U3KQV3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
U3KQV3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
U3KQV3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
U3KQV3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
U3KQV3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
U3KQV3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
U3KQV3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
U3KQV3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
U3KQV3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
U3KQV3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
U3KQV3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
U3KQV3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
U3KQV3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
U3KQV3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
U3KQV3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
U3KQV3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
U3KQV3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
U3KQV3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
U3KQV3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
U3KQV3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
U3KQV3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
U3KQV3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
U3KQV3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
U3KQV3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
U3KQV3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
U3KQV3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
U3KQV3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
U3KQV3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
U3KQV3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
U3KQV3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
U3KQV3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
U3KQV3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
U3KQV3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
U3KQV3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
U3KQV3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
U3KQV3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
U3KQV3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
U3KQV3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
U3KQV3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
U3KQV3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
U3KQV3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
U3KQV3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
U3KQV3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
U3KQV3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
U3KQV3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
U3KQV3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
U3KQV3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
U3KQV3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
U3KQV3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
U3KQV3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
U3KQV3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
U3KQV3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
U3KQV3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
U3KQV3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
U3KQV3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
U3KQV3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
U3KQV3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
U3KQV3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
U3KQV3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
U3KQV3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
U3KQV3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
U3KQV3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
U3KQV3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
U3KQV3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
U3KQV3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 206.7 ms