Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6X0

SETBP1, SET-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETBP1Q9Y6X0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
SETBP1Q9Y6X0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
SETBP1Q9Y6X0 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
SETBP1Q9Y6X0 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC33.78■■■■□ 3
SETBP1Q9Y6X0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
SETBP1Q9Y6X0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
SETBP1Q9Y6X0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
SETBP1Q9Y6X0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC33.77■■■■□ 3
SETBP1Q9Y6X0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
SETBP1Q9Y6X0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
SETBP1Q9Y6X0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
SETBP1Q9Y6X0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC33.77■■■■□ 3
SETBP1Q9Y6X0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
SETBP1Q9Y6X0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
SETBP1Q9Y6X0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
SETBP1Q9Y6X0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
SETBP1Q9Y6X0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
SETBP1Q9Y6X0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
SETBP1Q9Y6X0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
SETBP1Q9Y6X0 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
SETBP1Q9Y6X0 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
SETBP1Q9Y6X0 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
SETBP1Q9Y6X0 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
SETBP1Q9Y6X0 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
SETBP1Q9Y6X0 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
SETBP1Q9Y6X0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC33.74■■■□□ 2.99
SETBP1Q9Y6X0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
SETBP1Q9Y6X0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
SETBP1Q9Y6X0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
SETBP1Q9Y6X0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
SETBP1Q9Y6X0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
SETBP1Q9Y6X0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
SETBP1Q9Y6X0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
SETBP1Q9Y6X0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
SETBP1Q9Y6X0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
SETBP1Q9Y6X0 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
SETBP1Q9Y6X0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
SETBP1Q9Y6X0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
SETBP1Q9Y6X0 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
SETBP1Q9Y6X0 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
SETBP1Q9Y6X0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC33.71■■■□□ 2.99
SETBP1Q9Y6X0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
SETBP1Q9Y6X0 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
SETBP1Q9Y6X0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
SETBP1Q9Y6X0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
SETBP1Q9Y6X0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
SETBP1Q9Y6X0 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
SETBP1Q9Y6X0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
SETBP1Q9Y6X0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
SETBP1Q9Y6X0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
SETBP1Q9Y6X0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
SETBP1Q9Y6X0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
SETBP1Q9Y6X0 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
SETBP1Q9Y6X0 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
SETBP1Q9Y6X0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
SETBP1Q9Y6X0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
SETBP1Q9Y6X0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
SETBP1Q9Y6X0 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
SETBP1Q9Y6X0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
SETBP1Q9Y6X0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
SETBP1Q9Y6X0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
SETBP1Q9Y6X0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
SETBP1Q9Y6X0 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
SETBP1Q9Y6X0 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
SETBP1Q9Y6X0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
SETBP1Q9Y6X0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
SETBP1Q9Y6X0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
SETBP1Q9Y6X0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
SETBP1Q9Y6X0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
SETBP1Q9Y6X0 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC33.64■■■□□ 2.98
SETBP1Q9Y6X0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
SETBP1Q9Y6X0 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
SETBP1Q9Y6X0 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
SETBP1Q9Y6X0 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
SETBP1Q9Y6X0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
SETBP1Q9Y6X0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
SETBP1Q9Y6X0 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
SETBP1Q9Y6X0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
SETBP1Q9Y6X0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
SETBP1Q9Y6X0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
SETBP1Q9Y6X0 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
SETBP1Q9Y6X0 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
SETBP1Q9Y6X0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
SETBP1Q9Y6X0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
SETBP1Q9Y6X0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
SETBP1Q9Y6X0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
SETBP1Q9Y6X0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
SETBP1Q9Y6X0 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
SETBP1Q9Y6X0 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
SETBP1Q9Y6X0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
SETBP1Q9Y6X0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
SETBP1Q9Y6X0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
SETBP1Q9Y6X0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
SETBP1Q9Y6X0 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
SETBP1Q9Y6X0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
SETBP1Q9Y6X0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
SETBP1Q9Y6X0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
SETBP1Q9Y6X0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
SETBP1Q9Y6X0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
SETBP1Q9Y6X0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms