Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6B7

AP4B1, AP-4 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP4B1Q9Y6B7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AP4B1Q9Y6B7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AP4B1Q9Y6B7 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AP4B1Q9Y6B7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AP4B1Q9Y6B7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AP4B1Q9Y6B7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
AP4B1Q9Y6B7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AP4B1Q9Y6B7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AP4B1Q9Y6B7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AP4B1Q9Y6B7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AP4B1Q9Y6B7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AP4B1Q9Y6B7 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AP4B1Q9Y6B7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AP4B1Q9Y6B7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AP4B1Q9Y6B7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AP4B1Q9Y6B7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AP4B1Q9Y6B7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AP4B1Q9Y6B7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AP4B1Q9Y6B7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AP4B1Q9Y6B7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AP4B1Q9Y6B7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AP4B1Q9Y6B7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AP4B1Q9Y6B7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AP4B1Q9Y6B7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AP4B1Q9Y6B7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AP4B1Q9Y6B7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AP4B1Q9Y6B7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AP4B1Q9Y6B7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
AP4B1Q9Y6B7 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AP4B1Q9Y6B7 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AP4B1Q9Y6B7 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AP4B1Q9Y6B7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AP4B1Q9Y6B7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AP4B1Q9Y6B7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AP4B1Q9Y6B7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AP4B1Q9Y6B7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
AP4B1Q9Y6B7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AP4B1Q9Y6B7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
AP4B1Q9Y6B7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
AP4B1Q9Y6B7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
AP4B1Q9Y6B7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
AP4B1Q9Y6B7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
AP4B1Q9Y6B7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AP4B1Q9Y6B7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AP4B1Q9Y6B7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AP4B1Q9Y6B7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AP4B1Q9Y6B7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AP4B1Q9Y6B7 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AP4B1Q9Y6B7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP4B1Q9Y6B7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP4B1Q9Y6B7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP4B1Q9Y6B7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
AP4B1Q9Y6B7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP4B1Q9Y6B7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP4B1Q9Y6B7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP4B1Q9Y6B7 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP4B1Q9Y6B7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AP4B1Q9Y6B7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AP4B1Q9Y6B7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AP4B1Q9Y6B7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AP4B1Q9Y6B7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AP4B1Q9Y6B7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AP4B1Q9Y6B7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AP4B1Q9Y6B7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AP4B1Q9Y6B7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AP4B1Q9Y6B7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AP4B1Q9Y6B7 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AP4B1Q9Y6B7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AP4B1Q9Y6B7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AP4B1Q9Y6B7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AP4B1Q9Y6B7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AP4B1Q9Y6B7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AP4B1Q9Y6B7 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AP4B1Q9Y6B7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AP4B1Q9Y6B7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AP4B1Q9Y6B7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AP4B1Q9Y6B7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AP4B1Q9Y6B7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AP4B1Q9Y6B7 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AP4B1Q9Y6B7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AP4B1Q9Y6B7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AP4B1Q9Y6B7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AP4B1Q9Y6B7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AP4B1Q9Y6B7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AP4B1Q9Y6B7 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AP4B1Q9Y6B7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AP4B1Q9Y6B7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AP4B1Q9Y6B7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AP4B1Q9Y6B7 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AP4B1Q9Y6B7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AP4B1Q9Y6B7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AP4B1Q9Y6B7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AP4B1Q9Y6B7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AP4B1Q9Y6B7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AP4B1Q9Y6B7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AP4B1Q9Y6B7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AP4B1Q9Y6B7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AP4B1Q9Y6B7 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AP4B1Q9Y6B7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AP4B1Q9Y6B7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms