Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y625

GPC6, Glypican-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC6Q9Y625 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPC6Q9Y625 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPC6Q9Y625 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPC6Q9Y625 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPC6Q9Y625 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPC6Q9Y625 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPC6Q9Y625 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPC6Q9Y625 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPC6Q9Y625 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPC6Q9Y625 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPC6Q9Y625 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPC6Q9Y625 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPC6Q9Y625 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GPC6Q9Y625 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPC6Q9Y625 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPC6Q9Y625 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPC6Q9Y625 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPC6Q9Y625 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPC6Q9Y625 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPC6Q9Y625 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPC6Q9Y625 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPC6Q9Y625 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPC6Q9Y625 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPC6Q9Y625 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPC6Q9Y625 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GPC6Q9Y625 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPC6Q9Y625 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPC6Q9Y625 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPC6Q9Y625 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPC6Q9Y625 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPC6Q9Y625 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPC6Q9Y625 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPC6Q9Y625 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPC6Q9Y625 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPC6Q9Y625 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GPC6Q9Y625 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GPC6Q9Y625 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GPC6Q9Y625 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GPC6Q9Y625 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GPC6Q9Y625 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GPC6Q9Y625 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GPC6Q9Y625 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPC6Q9Y625 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPC6Q9Y625 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPC6Q9Y625 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPC6Q9Y625 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPC6Q9Y625 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPC6Q9Y625 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPC6Q9Y625 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GPC6Q9Y625 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GPC6Q9Y625 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GPC6Q9Y625 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GPC6Q9Y625 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GPC6Q9Y625 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GPC6Q9Y625 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GPC6Q9Y625 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GPC6Q9Y625 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GPC6Q9Y625 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GPC6Q9Y625 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GPC6Q9Y625 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPC6Q9Y625 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPC6Q9Y625 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPC6Q9Y625 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPC6Q9Y625 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPC6Q9Y625 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GPC6Q9Y625 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPC6Q9Y625 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPC6Q9Y625 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPC6Q9Y625 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPC6Q9Y625 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPC6Q9Y625 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPC6Q9Y625 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPC6Q9Y625 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GPC6Q9Y625 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GPC6Q9Y625 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GPC6Q9Y625 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GPC6Q9Y625 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GPC6Q9Y625 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GPC6Q9Y625 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GPC6Q9Y625 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GPC6Q9Y625 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GPC6Q9Y625 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GPC6Q9Y625 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPC6Q9Y625 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPC6Q9Y625 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPC6Q9Y625 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPC6Q9Y625 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPC6Q9Y625 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPC6Q9Y625 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPC6Q9Y625 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GPC6Q9Y625 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GPC6Q9Y625 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GPC6Q9Y625 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GPC6Q9Y625 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GPC6Q9Y625 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GPC6Q9Y625 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GPC6Q9Y625 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
GPC6Q9Y625 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPC6Q9Y625 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
GPC6Q9Y625 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms