Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX8Q9Y5X2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX8Q9Y5X2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX8Q9Y5X2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX8Q9Y5X2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX8Q9Y5X2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX8Q9Y5X2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX8Q9Y5X2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX8Q9Y5X2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX8Q9Y5X2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX8Q9Y5X2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX8Q9Y5X2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX8Q9Y5X2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX8Q9Y5X2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX8Q9Y5X2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX8Q9Y5X2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX8Q9Y5X2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX8Q9Y5X2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX8Q9Y5X2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX8Q9Y5X2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX8Q9Y5X2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX8Q9Y5X2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX8Q9Y5X2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX8Q9Y5X2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX8Q9Y5X2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX8Q9Y5X2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX8Q9Y5X2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX8Q9Y5X2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX8Q9Y5X2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX8Q9Y5X2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX8Q9Y5X2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX8Q9Y5X2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX8Q9Y5X2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX8Q9Y5X2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX8Q9Y5X2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX8Q9Y5X2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX8Q9Y5X2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX8Q9Y5X2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX8Q9Y5X2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX8Q9Y5X2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX8Q9Y5X2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX8Q9Y5X2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX8Q9Y5X2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX8Q9Y5X2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX8Q9Y5X2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX8Q9Y5X2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX8Q9Y5X2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX8Q9Y5X2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX8Q9Y5X2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX8Q9Y5X2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX8Q9Y5X2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX8Q9Y5X2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX8Q9Y5X2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX8Q9Y5X2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX8Q9Y5X2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX8Q9Y5X2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX8Q9Y5X2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX8Q9Y5X2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX8Q9Y5X2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX8Q9Y5X2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX8Q9Y5X2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX8Q9Y5X2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX8Q9Y5X2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX8Q9Y5X2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX8Q9Y5X2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX8Q9Y5X2 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX8Q9Y5X2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX8Q9Y5X2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX8Q9Y5X2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX8Q9Y5X2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX8Q9Y5X2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX8Q9Y5X2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX8Q9Y5X2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX8Q9Y5X2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX8Q9Y5X2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX8Q9Y5X2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX8Q9Y5X2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX8Q9Y5X2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX8Q9Y5X2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX8Q9Y5X2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX8Q9Y5X2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SNX8Q9Y5X2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX8Q9Y5X2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX8Q9Y5X2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX8Q9Y5X2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX8Q9Y5X2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX8Q9Y5X2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX8Q9Y5X2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX8Q9Y5X2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX8Q9Y5X2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX8Q9Y5X2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX8Q9Y5X2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX8Q9Y5X2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX8Q9Y5X2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX8Q9Y5X2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX8Q9Y5X2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX8Q9Y5X2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX8Q9Y5X2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX8Q9Y5X2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX8Q9Y5X2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms