Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5F3

PCDHB1, Protocadherin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB1Q9Y5F3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCDHB1Q9Y5F3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCDHB1Q9Y5F3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCDHB1Q9Y5F3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCDHB1Q9Y5F3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCDHB1Q9Y5F3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCDHB1Q9Y5F3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCDHB1Q9Y5F3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCDHB1Q9Y5F3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCDHB1Q9Y5F3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCDHB1Q9Y5F3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCDHB1Q9Y5F3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PCDHB1Q9Y5F3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCDHB1Q9Y5F3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCDHB1Q9Y5F3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCDHB1Q9Y5F3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCDHB1Q9Y5F3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHB1Q9Y5F3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHB1Q9Y5F3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHB1Q9Y5F3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHB1Q9Y5F3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHB1Q9Y5F3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHB1Q9Y5F3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHB1Q9Y5F3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDHB1Q9Y5F3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDHB1Q9Y5F3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDHB1Q9Y5F3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDHB1Q9Y5F3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDHB1Q9Y5F3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDHB1Q9Y5F3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDHB1Q9Y5F3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PCDHB1Q9Y5F3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHB1Q9Y5F3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHB1Q9Y5F3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHB1Q9Y5F3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHB1Q9Y5F3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHB1Q9Y5F3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHB1Q9Y5F3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHB1Q9Y5F3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHB1Q9Y5F3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHB1Q9Y5F3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHB1Q9Y5F3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHB1Q9Y5F3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHB1Q9Y5F3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHB1Q9Y5F3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHB1Q9Y5F3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHB1Q9Y5F3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHB1Q9Y5F3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHB1Q9Y5F3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHB1Q9Y5F3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHB1Q9Y5F3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHB1Q9Y5F3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHB1Q9Y5F3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHB1Q9Y5F3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHB1Q9Y5F3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHB1Q9Y5F3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHB1Q9Y5F3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHB1Q9Y5F3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHB1Q9Y5F3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHB1Q9Y5F3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHB1Q9Y5F3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHB1Q9Y5F3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHB1Q9Y5F3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHB1Q9Y5F3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHB1Q9Y5F3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHB1Q9Y5F3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHB1Q9Y5F3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHB1Q9Y5F3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHB1Q9Y5F3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHB1Q9Y5F3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHB1Q9Y5F3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHB1Q9Y5F3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHB1Q9Y5F3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHB1Q9Y5F3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHB1Q9Y5F3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHB1Q9Y5F3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHB1Q9Y5F3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHB1Q9Y5F3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHB1Q9Y5F3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHB1Q9Y5F3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHB1Q9Y5F3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHB1Q9Y5F3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHB1Q9Y5F3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHB1Q9Y5F3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHB1Q9Y5F3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHB1Q9Y5F3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHB1Q9Y5F3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PCDHB1Q9Y5F3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PCDHB1Q9Y5F3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PCDHB1Q9Y5F3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PCDHB1Q9Y5F3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PCDHB1Q9Y5F3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCDHB1Q9Y5F3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCDHB1Q9Y5F3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCDHB1Q9Y5F3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PCDHB1Q9Y5F3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCDHB1Q9Y5F3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDHB1Q9Y5F3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDHB1Q9Y5F3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDHB1Q9Y5F3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms