Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5F1

PCDHB12, Protocadherin beta-12, humanhuman

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB12Q9Y5F1 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PCDHB12Q9Y5F1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PCDHB12Q9Y5F1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PCDHB12Q9Y5F1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCDHB12Q9Y5F1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCDHB12Q9Y5F1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCDHB12Q9Y5F1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCDHB12Q9Y5F1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCDHB12Q9Y5F1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCDHB12Q9Y5F1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCDHB12Q9Y5F1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCDHB12Q9Y5F1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCDHB12Q9Y5F1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCDHB12Q9Y5F1 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PCDHB12Q9Y5F1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCDHB12Q9Y5F1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PCDHB12Q9Y5F1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCDHB12Q9Y5F1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCDHB12Q9Y5F1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCDHB12Q9Y5F1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCDHB12Q9Y5F1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCDHB12Q9Y5F1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCDHB12Q9Y5F1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCDHB12Q9Y5F1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCDHB12Q9Y5F1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCDHB12Q9Y5F1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PCDHB12Q9Y5F1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PCDHB12Q9Y5F1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PCDHB12Q9Y5F1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PCDHB12Q9Y5F1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PCDHB12Q9Y5F1 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PCDHB12Q9Y5F1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PCDHB12Q9Y5F1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PCDHB12Q9Y5F1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PCDHB12Q9Y5F1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
PCDHB12Q9Y5F1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCDHB12Q9Y5F1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCDHB12Q9Y5F1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCDHB12Q9Y5F1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCDHB12Q9Y5F1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCDHB12Q9Y5F1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PCDHB12Q9Y5F1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCDHB12Q9Y5F1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCDHB12Q9Y5F1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCDHB12Q9Y5F1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCDHB12Q9Y5F1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCDHB12Q9Y5F1 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCDHB12Q9Y5F1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCDHB12Q9Y5F1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCDHB12Q9Y5F1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCDHB12Q9Y5F1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCDHB12Q9Y5F1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCDHB12Q9Y5F1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PCDHB12Q9Y5F1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCDHB12Q9Y5F1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCDHB12Q9Y5F1 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCDHB12Q9Y5F1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PCDHB12Q9Y5F1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCDHB12Q9Y5F1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCDHB12Q9Y5F1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCDHB12Q9Y5F1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCDHB12Q9Y5F1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCDHB12Q9Y5F1 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PCDHB12Q9Y5F1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCDHB12Q9Y5F1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCDHB12Q9Y5F1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCDHB12Q9Y5F1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCDHB12Q9Y5F1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCDHB12Q9Y5F1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCDHB12Q9Y5F1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCDHB12Q9Y5F1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCDHB12Q9Y5F1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCDHB12Q9Y5F1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCDHB12Q9Y5F1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCDHB12Q9Y5F1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCDHB12Q9Y5F1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCDHB12Q9Y5F1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCDHB12Q9Y5F1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCDHB12Q9Y5F1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCDHB12Q9Y5F1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCDHB12Q9Y5F1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCDHB12Q9Y5F1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCDHB12Q9Y5F1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCDHB12Q9Y5F1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCDHB12Q9Y5F1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCDHB12Q9Y5F1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCDHB12Q9Y5F1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCDHB12Q9Y5F1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCDHB12Q9Y5F1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCDHB12Q9Y5F1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCDHB12Q9Y5F1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCDHB12Q9Y5F1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCDHB12Q9Y5F1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCDHB12Q9Y5F1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCDHB12Q9Y5F1 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCDHB12Q9Y5F1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCDHB12Q9Y5F1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCDHB12Q9Y5F1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCDHB12Q9Y5F1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCDHB12Q9Y5F1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms