Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E7

PCDHB2, Protocadherin beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB2Q9Y5E7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCDHB2Q9Y5E7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCDHB2Q9Y5E7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCDHB2Q9Y5E7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCDHB2Q9Y5E7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCDHB2Q9Y5E7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCDHB2Q9Y5E7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCDHB2Q9Y5E7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCDHB2Q9Y5E7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PCDHB2Q9Y5E7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCDHB2Q9Y5E7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCDHB2Q9Y5E7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCDHB2Q9Y5E7 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCDHB2Q9Y5E7 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCDHB2Q9Y5E7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCDHB2Q9Y5E7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCDHB2Q9Y5E7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCDHB2Q9Y5E7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCDHB2Q9Y5E7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCDHB2Q9Y5E7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCDHB2Q9Y5E7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PCDHB2Q9Y5E7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCDHB2Q9Y5E7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCDHB2Q9Y5E7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCDHB2Q9Y5E7 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCDHB2Q9Y5E7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PCDHB2Q9Y5E7 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCDHB2Q9Y5E7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCDHB2Q9Y5E7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCDHB2Q9Y5E7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PCDHB2Q9Y5E7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PCDHB2Q9Y5E7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PCDHB2Q9Y5E7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PCDHB2Q9Y5E7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PCDHB2Q9Y5E7 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PCDHB2Q9Y5E7 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PCDHB2Q9Y5E7 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PCDHB2Q9Y5E7 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PCDHB2Q9Y5E7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCDHB2Q9Y5E7 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCDHB2Q9Y5E7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCDHB2Q9Y5E7 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCDHB2Q9Y5E7 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCDHB2Q9Y5E7 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCDHB2Q9Y5E7 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCDHB2Q9Y5E7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PCDHB2Q9Y5E7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCDHB2Q9Y5E7 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCDHB2Q9Y5E7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCDHB2Q9Y5E7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCDHB2Q9Y5E7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCDHB2Q9Y5E7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCDHB2Q9Y5E7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCDHB2Q9Y5E7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCDHB2Q9Y5E7 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCDHB2Q9Y5E7 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCDHB2Q9Y5E7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PCDHB2Q9Y5E7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PCDHB2Q9Y5E7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PCDHB2Q9Y5E7 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PCDHB2Q9Y5E7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PCDHB2Q9Y5E7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PCDHB2Q9Y5E7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PCDHB2Q9Y5E7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCDHB2Q9Y5E7 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCDHB2Q9Y5E7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCDHB2Q9Y5E7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PCDHB2Q9Y5E7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCDHB2Q9Y5E7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCDHB2Q9Y5E7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCDHB2Q9Y5E7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCDHB2Q9Y5E7 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCDHB2Q9Y5E7 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PCDHB2Q9Y5E7 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PCDHB2Q9Y5E7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCDHB2Q9Y5E7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PCDHB2Q9Y5E7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCDHB2Q9Y5E7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCDHB2Q9Y5E7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCDHB2Q9Y5E7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCDHB2Q9Y5E7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PCDHB2Q9Y5E7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PCDHB2Q9Y5E7 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PCDHB2Q9Y5E7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PCDHB2Q9Y5E7 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PCDHB2Q9Y5E7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PCDHB2Q9Y5E7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PCDHB2Q9Y5E7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PCDHB2Q9Y5E7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PCDHB2Q9Y5E7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PCDHB2Q9Y5E7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PCDHB2Q9Y5E7 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PCDHB2Q9Y5E7 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PCDHB2Q9Y5E7 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PCDHB2Q9Y5E7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PCDHB2Q9Y5E7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PCDHB2Q9Y5E7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PCDHB2Q9Y5E7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PCDHB2Q9Y5E7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PCDHB2Q9Y5E7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms