Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E8

USP15, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 15, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15Q9Y4E8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP15Q9Y4E8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP15Q9Y4E8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP15Q9Y4E8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP15Q9Y4E8 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP15Q9Y4E8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP15Q9Y4E8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP15Q9Y4E8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP15Q9Y4E8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP15Q9Y4E8 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP15Q9Y4E8 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP15Q9Y4E8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP15Q9Y4E8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP15Q9Y4E8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP15Q9Y4E8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP15Q9Y4E8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP15Q9Y4E8 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP15Q9Y4E8 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP15Q9Y4E8 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
USP15Q9Y4E8 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP15Q9Y4E8 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
USP15Q9Y4E8 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP15Q9Y4E8 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP15Q9Y4E8 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP15Q9Y4E8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP15Q9Y4E8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP15Q9Y4E8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP15Q9Y4E8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP15Q9Y4E8 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP15Q9Y4E8 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
USP15Q9Y4E8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP15Q9Y4E8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP15Q9Y4E8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP15Q9Y4E8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP15Q9Y4E8 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP15Q9Y4E8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
USP15Q9Y4E8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
USP15Q9Y4E8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
USP15Q9Y4E8 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP15Q9Y4E8 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP15Q9Y4E8 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP15Q9Y4E8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP15Q9Y4E8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP15Q9Y4E8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP15Q9Y4E8 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
USP15Q9Y4E8 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP15Q9Y4E8 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP15Q9Y4E8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP15Q9Y4E8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP15Q9Y4E8 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
USP15Q9Y4E8 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
USP15Q9Y4E8 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
USP15Q9Y4E8 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
USP15Q9Y4E8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
USP15Q9Y4E8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP15Q9Y4E8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP15Q9Y4E8 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP15Q9Y4E8 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP15Q9Y4E8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP15Q9Y4E8 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP15Q9Y4E8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP15Q9Y4E8 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP15Q9Y4E8 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP15Q9Y4E8 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
USP15Q9Y4E8 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP15Q9Y4E8 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP15Q9Y4E8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
USP15Q9Y4E8 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP15Q9Y4E8 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
USP15Q9Y4E8 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
USP15Q9Y4E8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP15Q9Y4E8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP15Q9Y4E8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP15Q9Y4E8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP15Q9Y4E8 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP15Q9Y4E8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP15Q9Y4E8 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP15Q9Y4E8 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP15Q9Y4E8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
USP15Q9Y4E8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP15Q9Y4E8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP15Q9Y4E8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP15Q9Y4E8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP15Q9Y4E8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP15Q9Y4E8 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP15Q9Y4E8 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP15Q9Y4E8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP15Q9Y4E8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP15Q9Y4E8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
USP15Q9Y4E8 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP15Q9Y4E8 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
USP15Q9Y4E8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP15Q9Y4E8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP15Q9Y4E8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP15Q9Y4E8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP15Q9Y4E8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP15Q9Y4E8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP15Q9Y4E8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP15Q9Y4E8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP15Q9Y4E8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
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