Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B6

DCAF1, DDB1- and CUL4-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF1Q9Y4B6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC45.84■■■■■ 4.93
DCAF1Q9Y4B6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.83■■■■■ 4.93
DCAF1Q9Y4B6 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC45.83■■■■■ 4.93
DCAF1Q9Y4B6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.83■■■■■ 4.93
DCAF1Q9Y4B6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.83■■■■■ 4.93
DCAF1Q9Y4B6 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC45.83■■■■■ 4.93
DCAF1Q9Y4B6 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC45.82■■■■■ 4.93
DCAF1Q9Y4B6 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC45.82■■■■■ 4.93
DCAF1Q9Y4B6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.82■■■■■ 4.93
DCAF1Q9Y4B6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC45.82■■■■■ 4.93
DCAF1Q9Y4B6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC45.82■■■■■ 4.93
DCAF1Q9Y4B6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC45.82■■■■■ 4.92
DCAF1Q9Y4B6 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.82■■■■■ 4.92
DCAF1Q9Y4B6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.81■■■■■ 4.92
DCAF1Q9Y4B6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC45.81■■■■■ 4.92
DCAF1Q9Y4B6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.8■■■■■ 4.92
DCAF1Q9Y4B6 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC45.8■■■■■ 4.92
DCAF1Q9Y4B6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.8■■■■■ 4.92
DCAF1Q9Y4B6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.8■■■■■ 4.92
DCAF1Q9Y4B6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.8■■■■■ 4.92
DCAF1Q9Y4B6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.79■■■■■ 4.92
DCAF1Q9Y4B6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.79■■■■■ 4.92
DCAF1Q9Y4B6 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC45.79■■■■■ 4.92
DCAF1Q9Y4B6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.79■■■■■ 4.92
DCAF1Q9Y4B6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.78■■■■■ 4.92
DCAF1Q9Y4B6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.78■■■■■ 4.92
DCAF1Q9Y4B6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC45.78■■■■■ 4.92
DCAF1Q9Y4B6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC45.78■■■■■ 4.92
DCAF1Q9Y4B6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.77■■■■■ 4.92
DCAF1Q9Y4B6 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.77■■■■■ 4.92
DCAF1Q9Y4B6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC45.76■■■■■ 4.92
DCAF1Q9Y4B6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.76■■■■■ 4.92
DCAF1Q9Y4B6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.75■■■■■ 4.91
DCAF1Q9Y4B6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC45.75■■■■■ 4.91
DCAF1Q9Y4B6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC45.75■■■■■ 4.91
DCAF1Q9Y4B6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.74■■■■■ 4.91
DCAF1Q9Y4B6 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.74■■■■■ 4.91
DCAF1Q9Y4B6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.74■■■■■ 4.91
DCAF1Q9Y4B6 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.73■■■■■ 4.91
DCAF1Q9Y4B6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.73■■■■■ 4.91
DCAF1Q9Y4B6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.73■■■■■ 4.91
DCAF1Q9Y4B6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.72■■■■■ 4.91
DCAF1Q9Y4B6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC45.72■■■■■ 4.91
DCAF1Q9Y4B6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC45.72■■■■■ 4.91
DCAF1Q9Y4B6 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC45.72■■■■■ 4.91
DCAF1Q9Y4B6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC45.71■■■■■ 4.91
DCAF1Q9Y4B6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC45.71■■■■■ 4.91
DCAF1Q9Y4B6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC45.7■■■■■ 4.91
DCAF1Q9Y4B6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC45.7■■■■■ 4.91
DCAF1Q9Y4B6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.7■■■■■ 4.91
DCAF1Q9Y4B6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.69■■■■■ 4.9
DCAF1Q9Y4B6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC45.69■■■■■ 4.9
DCAF1Q9Y4B6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.68■■■■■ 4.9
DCAF1Q9Y4B6 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.68■■■■■ 4.9
DCAF1Q9Y4B6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC45.68■■■■■ 4.9
DCAF1Q9Y4B6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.68■■■■■ 4.9
DCAF1Q9Y4B6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.67■■■■■ 4.9
DCAF1Q9Y4B6 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC45.67■■■■■ 4.9
DCAF1Q9Y4B6 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC45.67■■■■■ 4.9
DCAF1Q9Y4B6 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC45.67■■■■■ 4.9
DCAF1Q9Y4B6 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC45.67■■■■■ 4.9
DCAF1Q9Y4B6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.67■■■■■ 4.9
DCAF1Q9Y4B6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC45.67■■■■■ 4.9
DCAF1Q9Y4B6 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC45.66■■■■■ 4.9
DCAF1Q9Y4B6 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC45.65■■■■■ 4.9
DCAF1Q9Y4B6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.65■■■■■ 4.9
DCAF1Q9Y4B6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.64■■■■■ 4.9
DCAF1Q9Y4B6 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.64■■■■■ 4.9
DCAF1Q9Y4B6 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC45.64■■■■■ 4.9
DCAF1Q9Y4B6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC45.64■■■■■ 4.9
DCAF1Q9Y4B6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.64■■■■■ 4.9
DCAF1Q9Y4B6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.64■■■■■ 4.9
DCAF1Q9Y4B6 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC45.63■■■■■ 4.9
DCAF1Q9Y4B6 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC45.62■■■■■ 4.89
DCAF1Q9Y4B6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC45.62■■■■■ 4.89
DCAF1Q9Y4B6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.62■■■■■ 4.89
DCAF1Q9Y4B6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.62■■■■■ 4.89
DCAF1Q9Y4B6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC45.62■■■■■ 4.89
DCAF1Q9Y4B6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.62■■■■■ 4.89
DCAF1Q9Y4B6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.62■■■■■ 4.89
DCAF1Q9Y4B6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.61■■■■■ 4.89
DCAF1Q9Y4B6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.61■■■■■ 4.89
DCAF1Q9Y4B6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC45.61■■■■■ 4.89
DCAF1Q9Y4B6 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC45.61■■■■■ 4.89
DCAF1Q9Y4B6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.6■■■■■ 4.89
DCAF1Q9Y4B6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.6■■■■■ 4.89
DCAF1Q9Y4B6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.59■■■■■ 4.89
DCAF1Q9Y4B6 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.58■■■■■ 4.89
DCAF1Q9Y4B6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.58■■■■■ 4.89
DCAF1Q9Y4B6 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.58■■■■■ 4.89
DCAF1Q9Y4B6 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC45.58■■■■■ 4.89
DCAF1Q9Y4B6 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC45.58■■■■■ 4.89
DCAF1Q9Y4B6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.58■■■■■ 4.89
DCAF1Q9Y4B6 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC45.57■■■■■ 4.89
DCAF1Q9Y4B6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC45.57■■■■■ 4.89
DCAF1Q9Y4B6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.57■■■■■ 4.89
DCAF1Q9Y4B6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.57■■■■■ 4.89
DCAF1Q9Y4B6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.57■■■■■ 4.89
DCAF1Q9Y4B6 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC45.57■■■■■ 4.88
DCAF1Q9Y4B6 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC45.57■■■■■ 4.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms