Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y478

PRKAB1, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB1Q9Y478 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKAB1Q9Y478 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKAB1Q9Y478 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKAB1Q9Y478 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKAB1Q9Y478 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKAB1Q9Y478 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKAB1Q9Y478 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKAB1Q9Y478 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKAB1Q9Y478 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKAB1Q9Y478 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKAB1Q9Y478 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKAB1Q9Y478 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKAB1Q9Y478 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKAB1Q9Y478 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKAB1Q9Y478 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKAB1Q9Y478 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKAB1Q9Y478 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRKAB1Q9Y478 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRKAB1Q9Y478 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRKAB1Q9Y478 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRKAB1Q9Y478 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PRKAB1Q9Y478 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRKAB1Q9Y478 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRKAB1Q9Y478 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRKAB1Q9Y478 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRKAB1Q9Y478 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRKAB1Q9Y478 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKAB1Q9Y478 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKAB1Q9Y478 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKAB1Q9Y478 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKAB1Q9Y478 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKAB1Q9Y478 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKAB1Q9Y478 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKAB1Q9Y478 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKAB1Q9Y478 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRKAB1Q9Y478 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRKAB1Q9Y478 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRKAB1Q9Y478 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRKAB1Q9Y478 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRKAB1Q9Y478 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRKAB1Q9Y478 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRKAB1Q9Y478 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRKAB1Q9Y478 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRKAB1Q9Y478 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRKAB1Q9Y478 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRKAB1Q9Y478 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRKAB1Q9Y478 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRKAB1Q9Y478 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRKAB1Q9Y478 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRKAB1Q9Y478 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRKAB1Q9Y478 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRKAB1Q9Y478 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRKAB1Q9Y478 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRKAB1Q9Y478 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRKAB1Q9Y478 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRKAB1Q9Y478 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRKAB1Q9Y478 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRKAB1Q9Y478 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRKAB1Q9Y478 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRKAB1Q9Y478 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRKAB1Q9Y478 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PRKAB1Q9Y478 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PRKAB1Q9Y478 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PRKAB1Q9Y478 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRKAB1Q9Y478 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRKAB1Q9Y478 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRKAB1Q9Y478 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRKAB1Q9Y478 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRKAB1Q9Y478 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRKAB1Q9Y478 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRKAB1Q9Y478 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRKAB1Q9Y478 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRKAB1Q9Y478 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PRKAB1Q9Y478 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRKAB1Q9Y478 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRKAB1Q9Y478 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRKAB1Q9Y478 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PRKAB1Q9Y478 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
PRKAB1Q9Y478 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PRKAB1Q9Y478 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRKAB1Q9Y478 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRKAB1Q9Y478 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRKAB1Q9Y478 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRKAB1Q9Y478 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRKAB1Q9Y478 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRKAB1Q9Y478 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRKAB1Q9Y478 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRKAB1Q9Y478 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRKAB1Q9Y478 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PRKAB1Q9Y478 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PRKAB1Q9Y478 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRKAB1Q9Y478 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRKAB1Q9Y478 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRKAB1Q9Y478 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRKAB1Q9Y478 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PRKAB1Q9Y478 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PRKAB1Q9Y478 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRKAB1Q9Y478 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRKAB1Q9Y478 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRKAB1Q9Y478 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms