Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y448

KNSTRN, Small kinetochore-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNSTRNQ9Y448 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
KNSTRNQ9Y448 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
KNSTRNQ9Y448 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC32.18■■■□□ 2.74
KNSTRNQ9Y448 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
KNSTRNQ9Y448 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
KNSTRNQ9Y448 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
KNSTRNQ9Y448 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
KNSTRNQ9Y448 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
KNSTRNQ9Y448 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
KNSTRNQ9Y448 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
KNSTRNQ9Y448 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
KNSTRNQ9Y448 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
KNSTRNQ9Y448 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
KNSTRNQ9Y448 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
KNSTRNQ9Y448 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
KNSTRNQ9Y448 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
KNSTRNQ9Y448 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
KNSTRNQ9Y448 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
KNSTRNQ9Y448 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
KNSTRNQ9Y448 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
KNSTRNQ9Y448 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
KNSTRNQ9Y448 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
KNSTRNQ9Y448 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
KNSTRNQ9Y448 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
KNSTRNQ9Y448 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
KNSTRNQ9Y448 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
KNSTRNQ9Y448 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
KNSTRNQ9Y448 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
KNSTRNQ9Y448 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
KNSTRNQ9Y448 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
KNSTRNQ9Y448 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
KNSTRNQ9Y448 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
KNSTRNQ9Y448 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
KNSTRNQ9Y448 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
KNSTRNQ9Y448 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
KNSTRNQ9Y448 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
KNSTRNQ9Y448 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
KNSTRNQ9Y448 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
KNSTRNQ9Y448 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
KNSTRNQ9Y448 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
KNSTRNQ9Y448 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
KNSTRNQ9Y448 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
KNSTRNQ9Y448 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
KNSTRNQ9Y448 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC32.1■■■□□ 2.73
KNSTRNQ9Y448 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
KNSTRNQ9Y448 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
KNSTRNQ9Y448 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
KNSTRNQ9Y448 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
KNSTRNQ9Y448 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
KNSTRNQ9Y448 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
KNSTRNQ9Y448 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
KNSTRNQ9Y448 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
KNSTRNQ9Y448 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
KNSTRNQ9Y448 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
KNSTRNQ9Y448 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
KNSTRNQ9Y448 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
KNSTRNQ9Y448 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
KNSTRNQ9Y448 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
KNSTRNQ9Y448 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
KNSTRNQ9Y448 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
KNSTRNQ9Y448 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
KNSTRNQ9Y448 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
KNSTRNQ9Y448 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.73
KNSTRNQ9Y448 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
KNSTRNQ9Y448 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
KNSTRNQ9Y448 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
KNSTRNQ9Y448 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
KNSTRNQ9Y448 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
KNSTRNQ9Y448 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
KNSTRNQ9Y448 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
KNSTRNQ9Y448 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
KNSTRNQ9Y448 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
KNSTRNQ9Y448 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
KNSTRNQ9Y448 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
KNSTRNQ9Y448 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
KNSTRNQ9Y448 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
KNSTRNQ9Y448 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
KNSTRNQ9Y448 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
KNSTRNQ9Y448 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
KNSTRNQ9Y448 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
KNSTRNQ9Y448 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
KNSTRNQ9Y448 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
KNSTRNQ9Y448 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
KNSTRNQ9Y448 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
KNSTRNQ9Y448 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
KNSTRNQ9Y448 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
KNSTRNQ9Y448 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
KNSTRNQ9Y448 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
KNSTRNQ9Y448 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
KNSTRNQ9Y448 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
KNSTRNQ9Y448 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
KNSTRNQ9Y448 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
KNSTRNQ9Y448 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
KNSTRNQ9Y448 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
KNSTRNQ9Y448 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
KNSTRNQ9Y448 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
KNSTRNQ9Y448 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
KNSTRNQ9Y448 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
KNSTRNQ9Y448 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
KNSTRNQ9Y448 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms