Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X8

UBE2D4, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D4, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2D4Q9Y2X8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
UBE2D4Q9Y2X8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
UBE2D4Q9Y2X8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
UBE2D4Q9Y2X8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
UBE2D4Q9Y2X8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
UBE2D4Q9Y2X8 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
UBE2D4Q9Y2X8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
UBE2D4Q9Y2X8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
UBE2D4Q9Y2X8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
UBE2D4Q9Y2X8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
UBE2D4Q9Y2X8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
UBE2D4Q9Y2X8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
UBE2D4Q9Y2X8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
UBE2D4Q9Y2X8 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
UBE2D4Q9Y2X8 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
UBE2D4Q9Y2X8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
UBE2D4Q9Y2X8 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
UBE2D4Q9Y2X8 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
UBE2D4Q9Y2X8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
UBE2D4Q9Y2X8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBE2D4Q9Y2X8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBE2D4Q9Y2X8 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBE2D4Q9Y2X8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBE2D4Q9Y2X8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBE2D4Q9Y2X8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBE2D4Q9Y2X8 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBE2D4Q9Y2X8 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
UBE2D4Q9Y2X8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBE2D4Q9Y2X8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
UBE2D4Q9Y2X8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBE2D4Q9Y2X8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBE2D4Q9Y2X8 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBE2D4Q9Y2X8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBE2D4Q9Y2X8 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBE2D4Q9Y2X8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBE2D4Q9Y2X8 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBE2D4Q9Y2X8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBE2D4Q9Y2X8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBE2D4Q9Y2X8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBE2D4Q9Y2X8 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
UBE2D4Q9Y2X8 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
UBE2D4Q9Y2X8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBE2D4Q9Y2X8 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBE2D4Q9Y2X8 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBE2D4Q9Y2X8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBE2D4Q9Y2X8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBE2D4Q9Y2X8 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBE2D4Q9Y2X8 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE2D4Q9Y2X8 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE2D4Q9Y2X8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE2D4Q9Y2X8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE2D4Q9Y2X8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE2D4Q9Y2X8 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE2D4Q9Y2X8 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE2D4Q9Y2X8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE2D4Q9Y2X8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE2D4Q9Y2X8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE2D4Q9Y2X8 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2D4Q9Y2X8 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2D4Q9Y2X8 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2D4Q9Y2X8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2D4Q9Y2X8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2D4Q9Y2X8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2D4Q9Y2X8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2D4Q9Y2X8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2D4Q9Y2X8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2D4Q9Y2X8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2D4Q9Y2X8 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2D4Q9Y2X8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2D4Q9Y2X8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2D4Q9Y2X8 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2D4Q9Y2X8 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2D4Q9Y2X8 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2D4Q9Y2X8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2D4Q9Y2X8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2D4Q9Y2X8 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2D4Q9Y2X8 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2D4Q9Y2X8 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2D4Q9Y2X8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2D4Q9Y2X8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2D4Q9Y2X8 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2D4Q9Y2X8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE2D4Q9Y2X8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE2D4Q9Y2X8 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE2D4Q9Y2X8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE2D4Q9Y2X8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE2D4Q9Y2X8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE2D4Q9Y2X8 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE2D4Q9Y2X8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE2D4Q9Y2X8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE2D4Q9Y2X8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE2D4Q9Y2X8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE2D4Q9Y2X8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE2D4Q9Y2X8 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE2D4Q9Y2X8 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE2D4Q9Y2X8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE2D4Q9Y2X8 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE2D4Q9Y2X8 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE2D4Q9Y2X8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE2D4Q9Y2X8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms