Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
TRAPPC8Q9Y2L5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
TRAPPC8Q9Y2L5 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
TRAPPC8Q9Y2L5 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC35.81■■■■□ 3.32
TRAPPC8Q9Y2L5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
TRAPPC8Q9Y2L5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
TRAPPC8Q9Y2L5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
TRAPPC8Q9Y2L5 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
TRAPPC8Q9Y2L5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
TRAPPC8Q9Y2L5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
TRAPPC8Q9Y2L5 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
TRAPPC8Q9Y2L5 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC35.79■■■■□ 3.32
TRAPPC8Q9Y2L5 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
TRAPPC8Q9Y2L5 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
TRAPPC8Q9Y2L5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
TRAPPC8Q9Y2L5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
TRAPPC8Q9Y2L5 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC35.77■■■■□ 3.32
TRAPPC8Q9Y2L5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC35.77■■■■□ 3.32
TRAPPC8Q9Y2L5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
TRAPPC8Q9Y2L5 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
TRAPPC8Q9Y2L5 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
TRAPPC8Q9Y2L5 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC35.76■■■■□ 3.32
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC35.76■■■■□ 3.32
TRAPPC8Q9Y2L5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
TRAPPC8Q9Y2L5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
TRAPPC8Q9Y2L5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
TRAPPC8Q9Y2L5 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
TRAPPC8Q9Y2L5 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
TRAPPC8Q9Y2L5 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
TRAPPC8Q9Y2L5 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC35.74■■■■□ 3.31
TRAPPC8Q9Y2L5 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
TRAPPC8Q9Y2L5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
TRAPPC8Q9Y2L5 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
TRAPPC8Q9Y2L5 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
TRAPPC8Q9Y2L5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
TRAPPC8Q9Y2L5 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
TRAPPC8Q9Y2L5 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
TRAPPC8Q9Y2L5 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
TRAPPC8Q9Y2L5 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC35.71■■■■□ 3.31
TRAPPC8Q9Y2L5 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC35.71■■■■□ 3.31
TRAPPC8Q9Y2L5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
TRAPPC8Q9Y2L5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
TRAPPC8Q9Y2L5 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC35.7■■■■□ 3.31
TRAPPC8Q9Y2L5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
TRAPPC8Q9Y2L5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
TRAPPC8Q9Y2L5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
TRAPPC8Q9Y2L5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.3
TRAPPC8Q9Y2L5 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
TRAPPC8Q9Y2L5 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
TRAPPC8Q9Y2L5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
TRAPPC8Q9Y2L5 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
TRAPPC8Q9Y2L5 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
TRAPPC8Q9Y2L5 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
TRAPPC8Q9Y2L5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
TRAPPC8Q9Y2L5 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
TRAPPC8Q9Y2L5 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
TRAPPC8Q9Y2L5 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
TRAPPC8Q9Y2L5 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
TRAPPC8Q9Y2L5 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
TRAPPC8Q9Y2L5 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
TRAPPC8Q9Y2L5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
TRAPPC8Q9Y2L5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
TRAPPC8Q9Y2L5 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.66■■■■□ 3.3
TRAPPC8Q9Y2L5 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC35.66■■■■□ 3.3
TRAPPC8Q9Y2L5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
TRAPPC8Q9Y2L5 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
TRAPPC8Q9Y2L5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
TRAPPC8Q9Y2L5 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
TRAPPC8Q9Y2L5 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC35.66■■■■□ 3.3
TRAPPC8Q9Y2L5 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
TRAPPC8Q9Y2L5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
TRAPPC8Q9Y2L5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
TRAPPC8Q9Y2L5 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
TRAPPC8Q9Y2L5 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
TRAPPC8Q9Y2L5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
TRAPPC8Q9Y2L5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
TRAPPC8Q9Y2L5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
TRAPPC8Q9Y2L5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
TRAPPC8Q9Y2L5 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
TRAPPC8Q9Y2L5 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
TRAPPC8Q9Y2L5 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
TRAPPC8Q9Y2L5 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC35.63■■■■□ 3.29
TRAPPC8Q9Y2L5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
TRAPPC8Q9Y2L5 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
TRAPPC8Q9Y2L5 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
TRAPPC8Q9Y2L5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC35.62■■■■□ 3.29
TRAPPC8Q9Y2L5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
TRAPPC8Q9Y2L5 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
TRAPPC8Q9Y2L5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
TRAPPC8Q9Y2L5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
TRAPPC8Q9Y2L5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
TRAPPC8Q9Y2L5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
TRAPPC8Q9Y2L5 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
TRAPPC8Q9Y2L5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
TRAPPC8Q9Y2L5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
TRAPPC8Q9Y2L5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
TRAPPC8Q9Y2L5 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.3 ms