Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2J0

RPH3A, Rabphilin-3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPH3AQ9Y2J0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPH3AQ9Y2J0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPH3AQ9Y2J0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPH3AQ9Y2J0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPH3AQ9Y2J0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPH3AQ9Y2J0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPH3AQ9Y2J0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPH3AQ9Y2J0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPH3AQ9Y2J0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPH3AQ9Y2J0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPH3AQ9Y2J0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RPH3AQ9Y2J0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPH3AQ9Y2J0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPH3AQ9Y2J0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPH3AQ9Y2J0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPH3AQ9Y2J0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPH3AQ9Y2J0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPH3AQ9Y2J0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPH3AQ9Y2J0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPH3AQ9Y2J0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RPH3AQ9Y2J0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RPH3AQ9Y2J0 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RPH3AQ9Y2J0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPH3AQ9Y2J0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPH3AQ9Y2J0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RPH3AQ9Y2J0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPH3AQ9Y2J0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPH3AQ9Y2J0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPH3AQ9Y2J0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPH3AQ9Y2J0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPH3AQ9Y2J0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPH3AQ9Y2J0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPH3AQ9Y2J0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPH3AQ9Y2J0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPH3AQ9Y2J0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPH3AQ9Y2J0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPH3AQ9Y2J0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPH3AQ9Y2J0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPH3AQ9Y2J0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPH3AQ9Y2J0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPH3AQ9Y2J0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPH3AQ9Y2J0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPH3AQ9Y2J0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPH3AQ9Y2J0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPH3AQ9Y2J0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPH3AQ9Y2J0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPH3AQ9Y2J0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPH3AQ9Y2J0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPH3AQ9Y2J0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPH3AQ9Y2J0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPH3AQ9Y2J0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPH3AQ9Y2J0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPH3AQ9Y2J0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPH3AQ9Y2J0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPH3AQ9Y2J0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPH3AQ9Y2J0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPH3AQ9Y2J0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPH3AQ9Y2J0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPH3AQ9Y2J0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPH3AQ9Y2J0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPH3AQ9Y2J0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RPH3AQ9Y2J0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RPH3AQ9Y2J0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPH3AQ9Y2J0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPH3AQ9Y2J0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RPH3AQ9Y2J0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPH3AQ9Y2J0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPH3AQ9Y2J0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPH3AQ9Y2J0 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPH3AQ9Y2J0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RPH3AQ9Y2J0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RPH3AQ9Y2J0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RPH3AQ9Y2J0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RPH3AQ9Y2J0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPH3AQ9Y2J0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RPH3AQ9Y2J0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPH3AQ9Y2J0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RPH3AQ9Y2J0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPH3AQ9Y2J0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RPH3AQ9Y2J0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPH3AQ9Y2J0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPH3AQ9Y2J0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPH3AQ9Y2J0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPH3AQ9Y2J0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPH3AQ9Y2J0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RPH3AQ9Y2J0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RPH3AQ9Y2J0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RPH3AQ9Y2J0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RPH3AQ9Y2J0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPH3AQ9Y2J0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RPH3AQ9Y2J0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPH3AQ9Y2J0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RPH3AQ9Y2J0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RPH3AQ9Y2J0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPH3AQ9Y2J0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RPH3AQ9Y2J0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RPH3AQ9Y2J0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPH3AQ9Y2J0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPH3AQ9Y2J0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RPH3AQ9Y2J0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms