Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y277

VDAC3, Voltage-dependent anion-selective channel protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VDAC3Q9Y277 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
VDAC3Q9Y277 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
VDAC3Q9Y277 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
VDAC3Q9Y277 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
VDAC3Q9Y277 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VDAC3Q9Y277 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VDAC3Q9Y277 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
VDAC3Q9Y277 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VDAC3Q9Y277 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VDAC3Q9Y277 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VDAC3Q9Y277 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VDAC3Q9Y277 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VDAC3Q9Y277 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VDAC3Q9Y277 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VDAC3Q9Y277 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VDAC3Q9Y277 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VDAC3Q9Y277 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VDAC3Q9Y277 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
VDAC3Q9Y277 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
VDAC3Q9Y277 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VDAC3Q9Y277 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VDAC3Q9Y277 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VDAC3Q9Y277 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VDAC3Q9Y277 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VDAC3Q9Y277 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VDAC3Q9Y277 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VDAC3Q9Y277 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VDAC3Q9Y277 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VDAC3Q9Y277 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VDAC3Q9Y277 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VDAC3Q9Y277 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VDAC3Q9Y277 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
VDAC3Q9Y277 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VDAC3Q9Y277 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VDAC3Q9Y277 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VDAC3Q9Y277 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VDAC3Q9Y277 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VDAC3Q9Y277 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VDAC3Q9Y277 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VDAC3Q9Y277 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VDAC3Q9Y277 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VDAC3Q9Y277 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VDAC3Q9Y277 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VDAC3Q9Y277 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VDAC3Q9Y277 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VDAC3Q9Y277 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VDAC3Q9Y277 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VDAC3Q9Y277 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VDAC3Q9Y277 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VDAC3Q9Y277 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VDAC3Q9Y277 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VDAC3Q9Y277 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VDAC3Q9Y277 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VDAC3Q9Y277 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VDAC3Q9Y277 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VDAC3Q9Y277 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VDAC3Q9Y277 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VDAC3Q9Y277 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VDAC3Q9Y277 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VDAC3Q9Y277 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VDAC3Q9Y277 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VDAC3Q9Y277 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VDAC3Q9Y277 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
VDAC3Q9Y277 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
VDAC3Q9Y277 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
VDAC3Q9Y277 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
VDAC3Q9Y277 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
VDAC3Q9Y277 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
VDAC3Q9Y277 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
VDAC3Q9Y277 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
VDAC3Q9Y277 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
VDAC3Q9Y277 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VDAC3Q9Y277 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VDAC3Q9Y277 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
VDAC3Q9Y277 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
VDAC3Q9Y277 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.31■■□□□ 1
VDAC3Q9Y277 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
VDAC3Q9Y277 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
VDAC3Q9Y277 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VDAC3Q9Y277 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VDAC3Q9Y277 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
VDAC3Q9Y277 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VDAC3Q9Y277 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VDAC3Q9Y277 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VDAC3Q9Y277 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VDAC3Q9Y277 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
VDAC3Q9Y277 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VDAC3Q9Y277 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.29■■□□□ 1
VDAC3Q9Y277 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
VDAC3Q9Y277 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.29■■□□□ 1
VDAC3Q9Y277 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.29■■□□□ 1
VDAC3Q9Y277 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VDAC3Q9Y277 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
VDAC3Q9Y277 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.29■■□□□ 1
VDAC3Q9Y277 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
VDAC3Q9Y277 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VDAC3Q9Y277 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
VDAC3Q9Y277 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
VDAC3Q9Y277 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VDAC3Q9Y277 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73 ms