Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y241

HIGD1A, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1AQ9Y241 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HIGD1AQ9Y241 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HIGD1AQ9Y241 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HIGD1AQ9Y241 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HIGD1AQ9Y241 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HIGD1AQ9Y241 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HIGD1AQ9Y241 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HIGD1AQ9Y241 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HIGD1AQ9Y241 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HIGD1AQ9Y241 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HIGD1AQ9Y241 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HIGD1AQ9Y241 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HIGD1AQ9Y241 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HIGD1AQ9Y241 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HIGD1AQ9Y241 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HIGD1AQ9Y241 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HIGD1AQ9Y241 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HIGD1AQ9Y241 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HIGD1AQ9Y241 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HIGD1AQ9Y241 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HIGD1AQ9Y241 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HIGD1AQ9Y241 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HIGD1AQ9Y241 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HIGD1AQ9Y241 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HIGD1AQ9Y241 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HIGD1AQ9Y241 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HIGD1AQ9Y241 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HIGD1AQ9Y241 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HIGD1AQ9Y241 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HIGD1AQ9Y241 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HIGD1AQ9Y241 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HIGD1AQ9Y241 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HIGD1AQ9Y241 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HIGD1AQ9Y241 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HIGD1AQ9Y241 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HIGD1AQ9Y241 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HIGD1AQ9Y241 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HIGD1AQ9Y241 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HIGD1AQ9Y241 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HIGD1AQ9Y241 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HIGD1AQ9Y241 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HIGD1AQ9Y241 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HIGD1AQ9Y241 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HIGD1AQ9Y241 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
HIGD1AQ9Y241 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HIGD1AQ9Y241 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HIGD1AQ9Y241 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HIGD1AQ9Y241 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HIGD1AQ9Y241 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HIGD1AQ9Y241 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HIGD1AQ9Y241 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HIGD1AQ9Y241 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HIGD1AQ9Y241 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HIGD1AQ9Y241 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HIGD1AQ9Y241 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HIGD1AQ9Y241 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HIGD1AQ9Y241 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HIGD1AQ9Y241 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HIGD1AQ9Y241 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
HIGD1AQ9Y241 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
HIGD1AQ9Y241 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
HIGD1AQ9Y241 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HIGD1AQ9Y241 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HIGD1AQ9Y241 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HIGD1AQ9Y241 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HIGD1AQ9Y241 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HIGD1AQ9Y241 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HIGD1AQ9Y241 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HIGD1AQ9Y241 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HIGD1AQ9Y241 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HIGD1AQ9Y241 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HIGD1AQ9Y241 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HIGD1AQ9Y241 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HIGD1AQ9Y241 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HIGD1AQ9Y241 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HIGD1AQ9Y241 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HIGD1AQ9Y241 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HIGD1AQ9Y241 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HIGD1AQ9Y241 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HIGD1AQ9Y241 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HIGD1AQ9Y241 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HIGD1AQ9Y241 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HIGD1AQ9Y241 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HIGD1AQ9Y241 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HIGD1AQ9Y241 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HIGD1AQ9Y241 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HIGD1AQ9Y241 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HIGD1AQ9Y241 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HIGD1AQ9Y241 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HIGD1AQ9Y241 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HIGD1AQ9Y241 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HIGD1AQ9Y241 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HIGD1AQ9Y241 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HIGD1AQ9Y241 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HIGD1AQ9Y241 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HIGD1AQ9Y241 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HIGD1AQ9Y241 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HIGD1AQ9Y241 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HIGD1AQ9Y241 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HIGD1AQ9Y241 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms