Protein–RNA interactions for Protein: Q9XRX5

HHLA3, HERV-H LTR-associating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA3Q9XRX5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HHLA3Q9XRX5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HHLA3Q9XRX5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HHLA3Q9XRX5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HHLA3Q9XRX5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HHLA3Q9XRX5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HHLA3Q9XRX5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HHLA3Q9XRX5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HHLA3Q9XRX5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HHLA3Q9XRX5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HHLA3Q9XRX5 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HHLA3Q9XRX5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HHLA3Q9XRX5 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HHLA3Q9XRX5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HHLA3Q9XRX5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HHLA3Q9XRX5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HHLA3Q9XRX5 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HHLA3Q9XRX5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HHLA3Q9XRX5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
HHLA3Q9XRX5 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HHLA3Q9XRX5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HHLA3Q9XRX5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HHLA3Q9XRX5 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HHLA3Q9XRX5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HHLA3Q9XRX5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HHLA3Q9XRX5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HHLA3Q9XRX5 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HHLA3Q9XRX5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HHLA3Q9XRX5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HHLA3Q9XRX5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HHLA3Q9XRX5 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HHLA3Q9XRX5 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HHLA3Q9XRX5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HHLA3Q9XRX5 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HHLA3Q9XRX5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
HHLA3Q9XRX5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HHLA3Q9XRX5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HHLA3Q9XRX5 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HHLA3Q9XRX5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HHLA3Q9XRX5 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HHLA3Q9XRX5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HHLA3Q9XRX5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HHLA3Q9XRX5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HHLA3Q9XRX5 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HHLA3Q9XRX5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HHLA3Q9XRX5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HHLA3Q9XRX5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HHLA3Q9XRX5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HHLA3Q9XRX5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HHLA3Q9XRX5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HHLA3Q9XRX5 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HHLA3Q9XRX5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HHLA3Q9XRX5 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
HHLA3Q9XRX5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HHLA3Q9XRX5 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HHLA3Q9XRX5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HHLA3Q9XRX5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HHLA3Q9XRX5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HHLA3Q9XRX5 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HHLA3Q9XRX5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HHLA3Q9XRX5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HHLA3Q9XRX5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HHLA3Q9XRX5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HHLA3Q9XRX5 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HHLA3Q9XRX5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HHLA3Q9XRX5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HHLA3Q9XRX5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HHLA3Q9XRX5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HHLA3Q9XRX5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HHLA3Q9XRX5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HHLA3Q9XRX5 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HHLA3Q9XRX5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HHLA3Q9XRX5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HHLA3Q9XRX5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HHLA3Q9XRX5 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HHLA3Q9XRX5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HHLA3Q9XRX5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HHLA3Q9XRX5 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HHLA3Q9XRX5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HHLA3Q9XRX5 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HHLA3Q9XRX5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HHLA3Q9XRX5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HHLA3Q9XRX5 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HHLA3Q9XRX5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HHLA3Q9XRX5 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HHLA3Q9XRX5 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HHLA3Q9XRX5 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HHLA3Q9XRX5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HHLA3Q9XRX5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HHLA3Q9XRX5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HHLA3Q9XRX5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HHLA3Q9XRX5 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HHLA3Q9XRX5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HHLA3Q9XRX5 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
HHLA3Q9XRX5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HHLA3Q9XRX5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HHLA3Q9XRX5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HHLA3Q9XRX5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HHLA3Q9XRX5 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HHLA3Q9XRX5 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms