Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQE7

SMC3, Structural maintenance of chromosomes protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC3Q9UQE7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SMC3Q9UQE7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
SMC3Q9UQE7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SMC3Q9UQE7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SMC3Q9UQE7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SMC3Q9UQE7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SMC3Q9UQE7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SMC3Q9UQE7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SMC3Q9UQE7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SMC3Q9UQE7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SMC3Q9UQE7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SMC3Q9UQE7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SMC3Q9UQE7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SMC3Q9UQE7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SMC3Q9UQE7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SMC3Q9UQE7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SMC3Q9UQE7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SMC3Q9UQE7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMC3Q9UQE7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMC3Q9UQE7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMC3Q9UQE7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMC3Q9UQE7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMC3Q9UQE7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMC3Q9UQE7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SMC3Q9UQE7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SMC3Q9UQE7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SMC3Q9UQE7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SMC3Q9UQE7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SMC3Q9UQE7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SMC3Q9UQE7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SMC3Q9UQE7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SMC3Q9UQE7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SMC3Q9UQE7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SMC3Q9UQE7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SMC3Q9UQE7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SMC3Q9UQE7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SMC3Q9UQE7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SMC3Q9UQE7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SMC3Q9UQE7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SMC3Q9UQE7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SMC3Q9UQE7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SMC3Q9UQE7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SMC3Q9UQE7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SMC3Q9UQE7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SMC3Q9UQE7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SMC3Q9UQE7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SMC3Q9UQE7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SMC3Q9UQE7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SMC3Q9UQE7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SMC3Q9UQE7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SMC3Q9UQE7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SMC3Q9UQE7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SMC3Q9UQE7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SMC3Q9UQE7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SMC3Q9UQE7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SMC3Q9UQE7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SMC3Q9UQE7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SMC3Q9UQE7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SMC3Q9UQE7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SMC3Q9UQE7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SMC3Q9UQE7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SMC3Q9UQE7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SMC3Q9UQE7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SMC3Q9UQE7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SMC3Q9UQE7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SMC3Q9UQE7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SMC3Q9UQE7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SMC3Q9UQE7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SMC3Q9UQE7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SMC3Q9UQE7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SMC3Q9UQE7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SMC3Q9UQE7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SMC3Q9UQE7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SMC3Q9UQE7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SMC3Q9UQE7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SMC3Q9UQE7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SMC3Q9UQE7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SMC3Q9UQE7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SMC3Q9UQE7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SMC3Q9UQE7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SMC3Q9UQE7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SMC3Q9UQE7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SMC3Q9UQE7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SMC3Q9UQE7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SMC3Q9UQE7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SMC3Q9UQE7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SMC3Q9UQE7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SMC3Q9UQE7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SMC3Q9UQE7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SMC3Q9UQE7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SMC3Q9UQE7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SMC3Q9UQE7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SMC3Q9UQE7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SMC3Q9UQE7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SMC3Q9UQE7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SMC3Q9UQE7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SMC3Q9UQE7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SMC3Q9UQE7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SMC3Q9UQE7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SMC3Q9UQE7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms