Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQC9

CLCA2, Calcium-activated chloride channel regulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCA2Q9UQC9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLCA2Q9UQC9 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CLCA2Q9UQC9 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CLCA2Q9UQC9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLCA2Q9UQC9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLCA2Q9UQC9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLCA2Q9UQC9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLCA2Q9UQC9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLCA2Q9UQC9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLCA2Q9UQC9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLCA2Q9UQC9 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLCA2Q9UQC9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLCA2Q9UQC9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLCA2Q9UQC9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLCA2Q9UQC9 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLCA2Q9UQC9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLCA2Q9UQC9 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLCA2Q9UQC9 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLCA2Q9UQC9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLCA2Q9UQC9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLCA2Q9UQC9 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLCA2Q9UQC9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLCA2Q9UQC9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLCA2Q9UQC9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLCA2Q9UQC9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLCA2Q9UQC9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CLCA2Q9UQC9 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CLCA2Q9UQC9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLCA2Q9UQC9 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLCA2Q9UQC9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLCA2Q9UQC9 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLCA2Q9UQC9 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLCA2Q9UQC9 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLCA2Q9UQC9 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CLCA2Q9UQC9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLCA2Q9UQC9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLCA2Q9UQC9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLCA2Q9UQC9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLCA2Q9UQC9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLCA2Q9UQC9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLCA2Q9UQC9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLCA2Q9UQC9 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLCA2Q9UQC9 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLCA2Q9UQC9 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLCA2Q9UQC9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLCA2Q9UQC9 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLCA2Q9UQC9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLCA2Q9UQC9 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLCA2Q9UQC9 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLCA2Q9UQC9 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CLCA2Q9UQC9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLCA2Q9UQC9 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLCA2Q9UQC9 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLCA2Q9UQC9 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLCA2Q9UQC9 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CLCA2Q9UQC9 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CLCA2Q9UQC9 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CLCA2Q9UQC9 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CLCA2Q9UQC9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLCA2Q9UQC9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLCA2Q9UQC9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLCA2Q9UQC9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLCA2Q9UQC9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLCA2Q9UQC9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLCA2Q9UQC9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLCA2Q9UQC9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLCA2Q9UQC9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLCA2Q9UQC9 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLCA2Q9UQC9 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLCA2Q9UQC9 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CLCA2Q9UQC9 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLCA2Q9UQC9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLCA2Q9UQC9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLCA2Q9UQC9 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLCA2Q9UQC9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLCA2Q9UQC9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLCA2Q9UQC9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLCA2Q9UQC9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLCA2Q9UQC9 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLCA2Q9UQC9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLCA2Q9UQC9 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLCA2Q9UQC9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CLCA2Q9UQC9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLCA2Q9UQC9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLCA2Q9UQC9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLCA2Q9UQC9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLCA2Q9UQC9 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLCA2Q9UQC9 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CLCA2Q9UQC9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLCA2Q9UQC9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLCA2Q9UQC9 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLCA2Q9UQC9 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLCA2Q9UQC9 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLCA2Q9UQC9 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CLCA2Q9UQC9 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLCA2Q9UQC9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLCA2Q9UQC9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLCA2Q9UQC9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLCA2Q9UQC9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLCA2Q9UQC9 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms