Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQB3

CTNND2, Catenin delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNND2Q9UQB3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CTNND2Q9UQB3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CTNND2Q9UQB3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CTNND2Q9UQB3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CTNND2Q9UQB3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CTNND2Q9UQB3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CTNND2Q9UQB3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CTNND2Q9UQB3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
CTNND2Q9UQB3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CTNND2Q9UQB3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CTNND2Q9UQB3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CTNND2Q9UQB3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CTNND2Q9UQB3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CTNND2Q9UQB3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CTNND2Q9UQB3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CTNND2Q9UQB3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CTNND2Q9UQB3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CTNND2Q9UQB3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CTNND2Q9UQB3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CTNND2Q9UQB3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CTNND2Q9UQB3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CTNND2Q9UQB3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CTNND2Q9UQB3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CTNND2Q9UQB3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CTNND2Q9UQB3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CTNND2Q9UQB3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CTNND2Q9UQB3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CTNND2Q9UQB3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CTNND2Q9UQB3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CTNND2Q9UQB3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CTNND2Q9UQB3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CTNND2Q9UQB3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CTNND2Q9UQB3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CTNND2Q9UQB3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CTNND2Q9UQB3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CTNND2Q9UQB3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CTNND2Q9UQB3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CTNND2Q9UQB3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CTNND2Q9UQB3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CTNND2Q9UQB3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CTNND2Q9UQB3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CTNND2Q9UQB3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CTNND2Q9UQB3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CTNND2Q9UQB3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CTNND2Q9UQB3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CTNND2Q9UQB3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CTNND2Q9UQB3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CTNND2Q9UQB3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CTNND2Q9UQB3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CTNND2Q9UQB3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CTNND2Q9UQB3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CTNND2Q9UQB3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CTNND2Q9UQB3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CTNND2Q9UQB3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CTNND2Q9UQB3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CTNND2Q9UQB3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CTNND2Q9UQB3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CTNND2Q9UQB3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CTNND2Q9UQB3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CTNND2Q9UQB3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CTNND2Q9UQB3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CTNND2Q9UQB3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CTNND2Q9UQB3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CTNND2Q9UQB3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CTNND2Q9UQB3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CTNND2Q9UQB3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CTNND2Q9UQB3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CTNND2Q9UQB3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CTNND2Q9UQB3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CTNND2Q9UQB3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CTNND2Q9UQB3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CTNND2Q9UQB3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CTNND2Q9UQB3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CTNND2Q9UQB3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CTNND2Q9UQB3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CTNND2Q9UQB3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CTNND2Q9UQB3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CTNND2Q9UQB3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CTNND2Q9UQB3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CTNND2Q9UQB3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CTNND2Q9UQB3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CTNND2Q9UQB3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CTNND2Q9UQB3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CTNND2Q9UQB3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CTNND2Q9UQB3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CTNND2Q9UQB3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CTNND2Q9UQB3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CTNND2Q9UQB3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CTNND2Q9UQB3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CTNND2Q9UQB3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CTNND2Q9UQB3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CTNND2Q9UQB3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CTNND2Q9UQB3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CTNND2Q9UQB3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CTNND2Q9UQB3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CTNND2Q9UQB3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CTNND2Q9UQB3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CTNND2Q9UQB3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTNND2Q9UQB3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTNND2Q9UQB3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms