Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ88

CDK11A, Cyclin-dependent kinase 11A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK11AQ9UQ88 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
CDK11AQ9UQ88 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
CDK11AQ9UQ88 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
CDK11AQ9UQ88 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
CDK11AQ9UQ88 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
CDK11AQ9UQ88 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC36.73■■■■□ 3.47
CDK11AQ9UQ88 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
CDK11AQ9UQ88 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
CDK11AQ9UQ88 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
CDK11AQ9UQ88 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
CDK11AQ9UQ88 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
CDK11AQ9UQ88 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
CDK11AQ9UQ88 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC36.72■■■■□ 3.47
CDK11AQ9UQ88 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC36.72■■■■□ 3.47
CDK11AQ9UQ88 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC36.71■■■■□ 3.47
CDK11AQ9UQ88 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
CDK11AQ9UQ88 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
CDK11AQ9UQ88 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
CDK11AQ9UQ88 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
CDK11AQ9UQ88 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
CDK11AQ9UQ88 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
CDK11AQ9UQ88 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
CDK11AQ9UQ88 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.46
CDK11AQ9UQ88 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC36.69■■■■□ 3.46
CDK11AQ9UQ88 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
CDK11AQ9UQ88 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
CDK11AQ9UQ88 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
CDK11AQ9UQ88 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
CDK11AQ9UQ88 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
CDK11AQ9UQ88 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
CDK11AQ9UQ88 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
CDK11AQ9UQ88 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC36.67■■■■□ 3.46
CDK11AQ9UQ88 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
CDK11AQ9UQ88 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
CDK11AQ9UQ88 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC36.65■■■■□ 3.46
CDK11AQ9UQ88 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC36.65■■■■□ 3.46
CDK11AQ9UQ88 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
CDK11AQ9UQ88 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
CDK11AQ9UQ88 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
CDK11AQ9UQ88 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.46
CDK11AQ9UQ88 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
CDK11AQ9UQ88 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
CDK11AQ9UQ88 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
CDK11AQ9UQ88 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
CDK11AQ9UQ88 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
CDK11AQ9UQ88 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
CDK11AQ9UQ88 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
CDK11AQ9UQ88 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
CDK11AQ9UQ88 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC36.62■■■■□ 3.45
CDK11AQ9UQ88 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
CDK11AQ9UQ88 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
CDK11AQ9UQ88 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
CDK11AQ9UQ88 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
CDK11AQ9UQ88 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
CDK11AQ9UQ88 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
CDK11AQ9UQ88 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
CDK11AQ9UQ88 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
CDK11AQ9UQ88 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
CDK11AQ9UQ88 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
CDK11AQ9UQ88 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
CDK11AQ9UQ88 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
CDK11AQ9UQ88 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
CDK11AQ9UQ88 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
CDK11AQ9UQ88 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
CDK11AQ9UQ88 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.44
CDK11AQ9UQ88 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC36.57■■■■□ 3.44
CDK11AQ9UQ88 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
CDK11AQ9UQ88 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
CDK11AQ9UQ88 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
CDK11AQ9UQ88 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC36.55■■■■□ 3.44
CDK11AQ9UQ88 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
CDK11AQ9UQ88 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC36.54■■■■□ 3.44
CDK11AQ9UQ88 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
CDK11AQ9UQ88 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC36.54■■■■□ 3.44
CDK11AQ9UQ88 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
CDK11AQ9UQ88 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
CDK11AQ9UQ88 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
CDK11AQ9UQ88 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
CDK11AQ9UQ88 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
CDK11AQ9UQ88 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC36.53■■■■□ 3.44
CDK11AQ9UQ88 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
CDK11AQ9UQ88 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
CDK11AQ9UQ88 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC36.52■■■■□ 3.44
CDK11AQ9UQ88 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
CDK11AQ9UQ88 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
CDK11AQ9UQ88 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
CDK11AQ9UQ88 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
CDK11AQ9UQ88 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
CDK11AQ9UQ88 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
CDK11AQ9UQ88 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
CDK11AQ9UQ88 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
CDK11AQ9UQ88 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
CDK11AQ9UQ88 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
CDK11AQ9UQ88 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
CDK11AQ9UQ88 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
CDK11AQ9UQ88 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
CDK11AQ9UQ88 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
CDK11AQ9UQ88 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
CDK11AQ9UQ88 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
CDK11AQ9UQ88 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms