Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SHOC2Q9UQ13 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SHOC2Q9UQ13 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SHOC2Q9UQ13 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SHOC2Q9UQ13 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SHOC2Q9UQ13 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SHOC2Q9UQ13 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SHOC2Q9UQ13 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SHOC2Q9UQ13 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SHOC2Q9UQ13 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SHOC2Q9UQ13 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SHOC2Q9UQ13 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SHOC2Q9UQ13 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SHOC2Q9UQ13 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SHOC2Q9UQ13 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SHOC2Q9UQ13 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SHOC2Q9UQ13 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SHOC2Q9UQ13 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SHOC2Q9UQ13 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SHOC2Q9UQ13 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SHOC2Q9UQ13 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SHOC2Q9UQ13 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SHOC2Q9UQ13 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SHOC2Q9UQ13 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SHOC2Q9UQ13 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SHOC2Q9UQ13 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SHOC2Q9UQ13 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SHOC2Q9UQ13 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SHOC2Q9UQ13 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SHOC2Q9UQ13 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SHOC2Q9UQ13 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SHOC2Q9UQ13 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SHOC2Q9UQ13 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHOC2Q9UQ13 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHOC2Q9UQ13 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHOC2Q9UQ13 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHOC2Q9UQ13 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHOC2Q9UQ13 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHOC2Q9UQ13 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SHOC2Q9UQ13 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SHOC2Q9UQ13 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SHOC2Q9UQ13 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SHOC2Q9UQ13 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SHOC2Q9UQ13 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SHOC2Q9UQ13 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SHOC2Q9UQ13 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SHOC2Q9UQ13 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SHOC2Q9UQ13 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SHOC2Q9UQ13 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SHOC2Q9UQ13 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SHOC2Q9UQ13 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SHOC2Q9UQ13 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SHOC2Q9UQ13 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SHOC2Q9UQ13 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SHOC2Q9UQ13 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SHOC2Q9UQ13 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SHOC2Q9UQ13 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SHOC2Q9UQ13 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SHOC2Q9UQ13 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SHOC2Q9UQ13 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SHOC2Q9UQ13 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SHOC2Q9UQ13 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SHOC2Q9UQ13 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SHOC2Q9UQ13 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SHOC2Q9UQ13 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SHOC2Q9UQ13 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SHOC2Q9UQ13 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SHOC2Q9UQ13 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SHOC2Q9UQ13 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SHOC2Q9UQ13 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SHOC2Q9UQ13 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SHOC2Q9UQ13 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SHOC2Q9UQ13 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SHOC2Q9UQ13 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SHOC2Q9UQ13 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SHOC2Q9UQ13 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SHOC2Q9UQ13 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SHOC2Q9UQ13 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SHOC2Q9UQ13 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SHOC2Q9UQ13 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SHOC2Q9UQ13 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SHOC2Q9UQ13 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SHOC2Q9UQ13 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SHOC2Q9UQ13 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SHOC2Q9UQ13 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SHOC2Q9UQ13 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SHOC2Q9UQ13 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SHOC2Q9UQ13 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SHOC2Q9UQ13 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SHOC2Q9UQ13 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SHOC2Q9UQ13 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SHOC2Q9UQ13 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SHOC2Q9UQ13 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SHOC2Q9UQ13 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SHOC2Q9UQ13 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SHOC2Q9UQ13 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SHOC2Q9UQ13 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SHOC2Q9UQ13 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SHOC2Q9UQ13 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SHOC2Q9UQ13 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
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