Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPY8

MAPRE3, Microtubule-associated protein RP/EB family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAPRE3Q9UPY8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MAPRE3Q9UPY8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MAPRE3Q9UPY8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MAPRE3Q9UPY8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MAPRE3Q9UPY8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MAPRE3Q9UPY8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MAPRE3Q9UPY8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MAPRE3Q9UPY8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MAPRE3Q9UPY8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MAPRE3Q9UPY8 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MAPRE3Q9UPY8 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MAPRE3Q9UPY8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MAPRE3Q9UPY8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MAPRE3Q9UPY8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MAPRE3Q9UPY8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MAPRE3Q9UPY8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MAPRE3Q9UPY8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MAPRE3Q9UPY8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MAPRE3Q9UPY8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MAPRE3Q9UPY8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MAPRE3Q9UPY8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MAPRE3Q9UPY8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MAPRE3Q9UPY8 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MAPRE3Q9UPY8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MAPRE3Q9UPY8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MAPRE3Q9UPY8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MAPRE3Q9UPY8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MAPRE3Q9UPY8 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MAPRE3Q9UPY8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MAPRE3Q9UPY8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MAPRE3Q9UPY8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MAPRE3Q9UPY8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MAPRE3Q9UPY8 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MAPRE3Q9UPY8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MAPRE3Q9UPY8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MAPRE3Q9UPY8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MAPRE3Q9UPY8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MAPRE3Q9UPY8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAPRE3Q9UPY8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAPRE3Q9UPY8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAPRE3Q9UPY8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAPRE3Q9UPY8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MAPRE3Q9UPY8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAPRE3Q9UPY8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAPRE3Q9UPY8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MAPRE3Q9UPY8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MAPRE3Q9UPY8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MAPRE3Q9UPY8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MAPRE3Q9UPY8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MAPRE3Q9UPY8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MAPRE3Q9UPY8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MAPRE3Q9UPY8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
MAPRE3Q9UPY8 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MAPRE3Q9UPY8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MAPRE3Q9UPY8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MAPRE3Q9UPY8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MAPRE3Q9UPY8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MAPRE3Q9UPY8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MAPRE3Q9UPY8 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MAPRE3Q9UPY8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MAPRE3Q9UPY8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MAPRE3Q9UPY8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MAPRE3Q9UPY8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MAPRE3Q9UPY8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MAPRE3Q9UPY8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MAPRE3Q9UPY8 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MAPRE3Q9UPY8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MAPRE3Q9UPY8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MAPRE3Q9UPY8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MAPRE3Q9UPY8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MAPRE3Q9UPY8 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MAPRE3Q9UPY8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MAPRE3Q9UPY8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MAPRE3Q9UPY8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MAPRE3Q9UPY8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MAPRE3Q9UPY8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAPRE3Q9UPY8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAPRE3Q9UPY8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAPRE3Q9UPY8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAPRE3Q9UPY8 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAPRE3Q9UPY8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAPRE3Q9UPY8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MAPRE3Q9UPY8 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MAPRE3Q9UPY8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MAPRE3Q9UPY8 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MAPRE3Q9UPY8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MAPRE3Q9UPY8 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MAPRE3Q9UPY8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MAPRE3Q9UPY8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MAPRE3Q9UPY8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MAPRE3Q9UPY8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MAPRE3Q9UPY8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MAPRE3Q9UPY8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MAPRE3Q9UPY8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MAPRE3Q9UPY8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MAPRE3Q9UPY8 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MAPRE3Q9UPY8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MAPRE3Q9UPY8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MAPRE3Q9UPY8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MAPRE3Q9UPY8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.1 ms