Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPW6

SATB2, DNA-binding protein SATB2, humanhuman

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SATB2Q9UPW6 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SATB2Q9UPW6 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SATB2Q9UPW6 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SATB2Q9UPW6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SATB2Q9UPW6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SATB2Q9UPW6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SATB2Q9UPW6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SATB2Q9UPW6 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SATB2Q9UPW6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SATB2Q9UPW6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SATB2Q9UPW6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SATB2Q9UPW6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SATB2Q9UPW6 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SATB2Q9UPW6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SATB2Q9UPW6 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SATB2Q9UPW6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SATB2Q9UPW6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SATB2Q9UPW6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SATB2Q9UPW6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SATB2Q9UPW6 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SATB2Q9UPW6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SATB2Q9UPW6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SATB2Q9UPW6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SATB2Q9UPW6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SATB2Q9UPW6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SATB2Q9UPW6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SATB2Q9UPW6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SATB2Q9UPW6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SATB2Q9UPW6 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SATB2Q9UPW6 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SATB2Q9UPW6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SATB2Q9UPW6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SATB2Q9UPW6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SATB2Q9UPW6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SATB2Q9UPW6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SATB2Q9UPW6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SATB2Q9UPW6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SATB2Q9UPW6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SATB2Q9UPW6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SATB2Q9UPW6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SATB2Q9UPW6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SATB2Q9UPW6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SATB2Q9UPW6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SATB2Q9UPW6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SATB2Q9UPW6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SATB2Q9UPW6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SATB2Q9UPW6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SATB2Q9UPW6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SATB2Q9UPW6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SATB2Q9UPW6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SATB2Q9UPW6 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SATB2Q9UPW6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SATB2Q9UPW6 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SATB2Q9UPW6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SATB2Q9UPW6 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SATB2Q9UPW6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SATB2Q9UPW6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SATB2Q9UPW6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SATB2Q9UPW6 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SATB2Q9UPW6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SATB2Q9UPW6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SATB2Q9UPW6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SATB2Q9UPW6 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SATB2Q9UPW6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SATB2Q9UPW6 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SATB2Q9UPW6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SATB2Q9UPW6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SATB2Q9UPW6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SATB2Q9UPW6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SATB2Q9UPW6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SATB2Q9UPW6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SATB2Q9UPW6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SATB2Q9UPW6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SATB2Q9UPW6 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SATB2Q9UPW6 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SATB2Q9UPW6 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SATB2Q9UPW6 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SATB2Q9UPW6 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SATB2Q9UPW6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SATB2Q9UPW6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SATB2Q9UPW6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SATB2Q9UPW6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SATB2Q9UPW6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SATB2Q9UPW6 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SATB2Q9UPW6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SATB2Q9UPW6 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SATB2Q9UPW6 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SATB2Q9UPW6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SATB2Q9UPW6 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SATB2Q9UPW6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SATB2Q9UPW6 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SATB2Q9UPW6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SATB2Q9UPW6 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SATB2Q9UPW6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SATB2Q9UPW6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SATB2Q9UPW6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SATB2Q9UPW6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SATB2Q9UPW6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SATB2Q9UPW6 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SATB2Q9UPW6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms