Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN30

SCML1, Sex comb on midleg-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCML1Q9UN30 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SCML1Q9UN30 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCML1Q9UN30 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCML1Q9UN30 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCML1Q9UN30 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCML1Q9UN30 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCML1Q9UN30 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCML1Q9UN30 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCML1Q9UN30 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCML1Q9UN30 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCML1Q9UN30 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCML1Q9UN30 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCML1Q9UN30 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCML1Q9UN30 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCML1Q9UN30 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCML1Q9UN30 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCML1Q9UN30 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCML1Q9UN30 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCML1Q9UN30 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCML1Q9UN30 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCML1Q9UN30 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCML1Q9UN30 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCML1Q9UN30 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SCML1Q9UN30 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SCML1Q9UN30 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCML1Q9UN30 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCML1Q9UN30 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCML1Q9UN30 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCML1Q9UN30 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCML1Q9UN30 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCML1Q9UN30 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SCML1Q9UN30 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SCML1Q9UN30 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCML1Q9UN30 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCML1Q9UN30 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCML1Q9UN30 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCML1Q9UN30 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SCML1Q9UN30 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCML1Q9UN30 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCML1Q9UN30 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCML1Q9UN30 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCML1Q9UN30 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCML1Q9UN30 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCML1Q9UN30 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCML1Q9UN30 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCML1Q9UN30 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCML1Q9UN30 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCML1Q9UN30 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCML1Q9UN30 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCML1Q9UN30 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCML1Q9UN30 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
SCML1Q9UN30 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCML1Q9UN30 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCML1Q9UN30 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCML1Q9UN30 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCML1Q9UN30 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCML1Q9UN30 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCML1Q9UN30 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SCML1Q9UN30 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCML1Q9UN30 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCML1Q9UN30 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCML1Q9UN30 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCML1Q9UN30 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCML1Q9UN30 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCML1Q9UN30 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCML1Q9UN30 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCML1Q9UN30 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCML1Q9UN30 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCML1Q9UN30 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCML1Q9UN30 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCML1Q9UN30 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCML1Q9UN30 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCML1Q9UN30 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCML1Q9UN30 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SCML1Q9UN30 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCML1Q9UN30 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCML1Q9UN30 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCML1Q9UN30 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCML1Q9UN30 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCML1Q9UN30 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCML1Q9UN30 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCML1Q9UN30 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCML1Q9UN30 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCML1Q9UN30 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCML1Q9UN30 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCML1Q9UN30 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCML1Q9UN30 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SCML1Q9UN30 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCML1Q9UN30 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SCML1Q9UN30 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCML1Q9UN30 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCML1Q9UN30 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCML1Q9UN30 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCML1Q9UN30 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCML1Q9UN30 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SCML1Q9UN30 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCML1Q9UN30 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCML1Q9UN30 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SCML1Q9UN30 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SCML1Q9UN30 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms