Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULW8

PADI3, Protein-arginine deiminase type-3, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI3Q9ULW8 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PADI3Q9ULW8 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PADI3Q9ULW8 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PADI3Q9ULW8 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PADI3Q9ULW8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PADI3Q9ULW8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PADI3Q9ULW8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PADI3Q9ULW8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PADI3Q9ULW8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PADI3Q9ULW8 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PADI3Q9ULW8 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PADI3Q9ULW8 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PADI3Q9ULW8 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PADI3Q9ULW8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PADI3Q9ULW8 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PADI3Q9ULW8 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PADI3Q9ULW8 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PADI3Q9ULW8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PADI3Q9ULW8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PADI3Q9ULW8 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PADI3Q9ULW8 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PADI3Q9ULW8 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PADI3Q9ULW8 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PADI3Q9ULW8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PADI3Q9ULW8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PADI3Q9ULW8 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PADI3Q9ULW8 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PADI3Q9ULW8 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PADI3Q9ULW8 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PADI3Q9ULW8 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PADI3Q9ULW8 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PADI3Q9ULW8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PADI3Q9ULW8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PADI3Q9ULW8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PADI3Q9ULW8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PADI3Q9ULW8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PADI3Q9ULW8 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PADI3Q9ULW8 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PADI3Q9ULW8 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PADI3Q9ULW8 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PADI3Q9ULW8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PADI3Q9ULW8 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PADI3Q9ULW8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PADI3Q9ULW8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PADI3Q9ULW8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PADI3Q9ULW8 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PADI3Q9ULW8 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PADI3Q9ULW8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PADI3Q9ULW8 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PADI3Q9ULW8 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PADI3Q9ULW8 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PADI3Q9ULW8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PADI3Q9ULW8 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PADI3Q9ULW8 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PADI3Q9ULW8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PADI3Q9ULW8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PADI3Q9ULW8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PADI3Q9ULW8 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PADI3Q9ULW8 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PADI3Q9ULW8 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PADI3Q9ULW8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PADI3Q9ULW8 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PADI3Q9ULW8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PADI3Q9ULW8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PADI3Q9ULW8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PADI3Q9ULW8 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PADI3Q9ULW8 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PADI3Q9ULW8 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PADI3Q9ULW8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PADI3Q9ULW8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PADI3Q9ULW8 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PADI3Q9ULW8 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PADI3Q9ULW8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PADI3Q9ULW8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PADI3Q9ULW8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PADI3Q9ULW8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PADI3Q9ULW8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PADI3Q9ULW8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PADI3Q9ULW8 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PADI3Q9ULW8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PADI3Q9ULW8 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PADI3Q9ULW8 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PADI3Q9ULW8 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PADI3Q9ULW8 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PADI3Q9ULW8 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PADI3Q9ULW8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PADI3Q9ULW8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PADI3Q9ULW8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PADI3Q9ULW8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PADI3Q9ULW8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PADI3Q9ULW8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PADI3Q9ULW8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PADI3Q9ULW8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PADI3Q9ULW8 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PADI3Q9ULW8 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PADI3Q9ULW8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PADI3Q9ULW8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PADI3Q9ULW8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PADI3Q9ULW8 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PADI3Q9ULW8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.1 ms