Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULI2

RIMKLB, Beta-citrylglutamate synthase B, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMKLBQ9ULI2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIMKLBQ9ULI2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIMKLBQ9ULI2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIMKLBQ9ULI2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIMKLBQ9ULI2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIMKLBQ9ULI2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIMKLBQ9ULI2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RIMKLBQ9ULI2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIMKLBQ9ULI2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIMKLBQ9ULI2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIMKLBQ9ULI2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIMKLBQ9ULI2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIMKLBQ9ULI2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIMKLBQ9ULI2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIMKLBQ9ULI2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIMKLBQ9ULI2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIMKLBQ9ULI2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RIMKLBQ9ULI2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIMKLBQ9ULI2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIMKLBQ9ULI2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIMKLBQ9ULI2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIMKLBQ9ULI2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIMKLBQ9ULI2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIMKLBQ9ULI2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIMKLBQ9ULI2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RIMKLBQ9ULI2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RIMKLBQ9ULI2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RIMKLBQ9ULI2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RIMKLBQ9ULI2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RIMKLBQ9ULI2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RIMKLBQ9ULI2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RIMKLBQ9ULI2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RIMKLBQ9ULI2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RIMKLBQ9ULI2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RIMKLBQ9ULI2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RIMKLBQ9ULI2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RIMKLBQ9ULI2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RIMKLBQ9ULI2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RIMKLBQ9ULI2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RIMKLBQ9ULI2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RIMKLBQ9ULI2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIMKLBQ9ULI2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIMKLBQ9ULI2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RIMKLBQ9ULI2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIMKLBQ9ULI2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIMKLBQ9ULI2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIMKLBQ9ULI2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIMKLBQ9ULI2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIMKLBQ9ULI2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIMKLBQ9ULI2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIMKLBQ9ULI2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIMKLBQ9ULI2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIMKLBQ9ULI2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIMKLBQ9ULI2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIMKLBQ9ULI2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
RIMKLBQ9ULI2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RIMKLBQ9ULI2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RIMKLBQ9ULI2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RIMKLBQ9ULI2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RIMKLBQ9ULI2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RIMKLBQ9ULI2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RIMKLBQ9ULI2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RIMKLBQ9ULI2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RIMKLBQ9ULI2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RIMKLBQ9ULI2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RIMKLBQ9ULI2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RIMKLBQ9ULI2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RIMKLBQ9ULI2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RIMKLBQ9ULI2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RIMKLBQ9ULI2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RIMKLBQ9ULI2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RIMKLBQ9ULI2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RIMKLBQ9ULI2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RIMKLBQ9ULI2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RIMKLBQ9ULI2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RIMKLBQ9ULI2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RIMKLBQ9ULI2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RIMKLBQ9ULI2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RIMKLBQ9ULI2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RIMKLBQ9ULI2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RIMKLBQ9ULI2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RIMKLBQ9ULI2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RIMKLBQ9ULI2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RIMKLBQ9ULI2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RIMKLBQ9ULI2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RIMKLBQ9ULI2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RIMKLBQ9ULI2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RIMKLBQ9ULI2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RIMKLBQ9ULI2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RIMKLBQ9ULI2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RIMKLBQ9ULI2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RIMKLBQ9ULI2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RIMKLBQ9ULI2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RIMKLBQ9ULI2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RIMKLBQ9ULI2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RIMKLBQ9ULI2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RIMKLBQ9ULI2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RIMKLBQ9ULI2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RIMKLBQ9ULI2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RIMKLBQ9ULI2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms