Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRAPPC2LQ9UL33 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRAPPC2LQ9UL33 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAPPC2LQ9UL33 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAPPC2LQ9UL33 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAPPC2LQ9UL33 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAPPC2LQ9UL33 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAPPC2LQ9UL33 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAPPC2LQ9UL33 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAPPC2LQ9UL33 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAPPC2LQ9UL33 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAPPC2LQ9UL33 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAPPC2LQ9UL33 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAPPC2LQ9UL33 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAPPC2LQ9UL33 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAPPC2LQ9UL33 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAPPC2LQ9UL33 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAPPC2LQ9UL33 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAPPC2LQ9UL33 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAPPC2LQ9UL33 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAPPC2LQ9UL33 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAPPC2LQ9UL33 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAPPC2LQ9UL33 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAPPC2LQ9UL33 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAPPC2LQ9UL33 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAPPC2LQ9UL33 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAPPC2LQ9UL33 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAPPC2LQ9UL33 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAPPC2LQ9UL33 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAPPC2LQ9UL33 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAPPC2LQ9UL33 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAPPC2LQ9UL33 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAPPC2LQ9UL33 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAPPC2LQ9UL33 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAPPC2LQ9UL33 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAPPC2LQ9UL33 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAPPC2LQ9UL33 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAPPC2LQ9UL33 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAPPC2LQ9UL33 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAPPC2LQ9UL33 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAPPC2LQ9UL33 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAPPC2LQ9UL33 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAPPC2LQ9UL33 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRAPPC2LQ9UL33 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRAPPC2LQ9UL33 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRAPPC2LQ9UL33 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRAPPC2LQ9UL33 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRAPPC2LQ9UL33 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRAPPC2LQ9UL33 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRAPPC2LQ9UL33 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRAPPC2LQ9UL33 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
TRAPPC2LQ9UL33 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRAPPC2LQ9UL33 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
TRAPPC2LQ9UL33 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRAPPC2LQ9UL33 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRAPPC2LQ9UL33 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRAPPC2LQ9UL33 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRAPPC2LQ9UL33 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAPPC2LQ9UL33 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAPPC2LQ9UL33 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAPPC2LQ9UL33 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAPPC2LQ9UL33 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAPPC2LQ9UL33 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAPPC2LQ9UL33 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAPPC2LQ9UL33 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAPPC2LQ9UL33 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAPPC2LQ9UL33 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAPPC2LQ9UL33 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAPPC2LQ9UL33 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAPPC2LQ9UL33 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAPPC2LQ9UL33 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAPPC2LQ9UL33 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAPPC2LQ9UL33 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAPPC2LQ9UL33 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAPPC2LQ9UL33 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAPPC2LQ9UL33 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAPPC2LQ9UL33 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAPPC2LQ9UL33 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAPPC2LQ9UL33 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAPPC2LQ9UL33 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAPPC2LQ9UL33 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAPPC2LQ9UL33 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAPPC2LQ9UL33 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAPPC2LQ9UL33 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAPPC2LQ9UL33 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAPPC2LQ9UL33 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAPPC2LQ9UL33 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAPPC2LQ9UL33 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAPPC2LQ9UL33 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAPPC2LQ9UL33 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAPPC2LQ9UL33 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAPPC2LQ9UL33 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAPPC2LQ9UL33 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAPPC2LQ9UL33 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAPPC2LQ9UL33 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAPPC2LQ9UL33 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms