Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKQ2

ADAM28, Disintegrin and metalloproteinase domain-containing protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ADAM28Q9UKQ2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ADAM28Q9UKQ2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ADAM28Q9UKQ2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ADAM28Q9UKQ2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ADAM28Q9UKQ2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ADAM28Q9UKQ2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ADAM28Q9UKQ2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ADAM28Q9UKQ2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ADAM28Q9UKQ2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ADAM28Q9UKQ2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ADAM28Q9UKQ2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ADAM28Q9UKQ2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ADAM28Q9UKQ2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ADAM28Q9UKQ2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ADAM28Q9UKQ2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ADAM28Q9UKQ2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ADAM28Q9UKQ2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ADAM28Q9UKQ2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ADAM28Q9UKQ2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ADAM28Q9UKQ2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ADAM28Q9UKQ2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ADAM28Q9UKQ2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ADAM28Q9UKQ2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ADAM28Q9UKQ2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ADAM28Q9UKQ2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ADAM28Q9UKQ2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ADAM28Q9UKQ2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ADAM28Q9UKQ2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ADAM28Q9UKQ2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ADAM28Q9UKQ2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ADAM28Q9UKQ2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ADAM28Q9UKQ2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ADAM28Q9UKQ2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ADAM28Q9UKQ2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ADAM28Q9UKQ2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ADAM28Q9UKQ2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ADAM28Q9UKQ2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ADAM28Q9UKQ2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ADAM28Q9UKQ2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ADAM28Q9UKQ2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ADAM28Q9UKQ2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ADAM28Q9UKQ2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ADAM28Q9UKQ2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ADAM28Q9UKQ2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ADAM28Q9UKQ2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ADAM28Q9UKQ2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ADAM28Q9UKQ2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ADAM28Q9UKQ2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ADAM28Q9UKQ2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ADAM28Q9UKQ2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ADAM28Q9UKQ2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ADAM28Q9UKQ2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ADAM28Q9UKQ2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ADAM28Q9UKQ2 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ADAM28Q9UKQ2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ADAM28Q9UKQ2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ADAM28Q9UKQ2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ADAM28Q9UKQ2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ADAM28Q9UKQ2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ADAM28Q9UKQ2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ADAM28Q9UKQ2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ADAM28Q9UKQ2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ADAM28Q9UKQ2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ADAM28Q9UKQ2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ADAM28Q9UKQ2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ADAM28Q9UKQ2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ADAM28Q9UKQ2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ADAM28Q9UKQ2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ADAM28Q9UKQ2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ADAM28Q9UKQ2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ADAM28Q9UKQ2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ADAM28Q9UKQ2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ADAM28Q9UKQ2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ADAM28Q9UKQ2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ADAM28Q9UKQ2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ADAM28Q9UKQ2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ADAM28Q9UKQ2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ADAM28Q9UKQ2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ADAM28Q9UKQ2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ADAM28Q9UKQ2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ADAM28Q9UKQ2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ADAM28Q9UKQ2 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ADAM28Q9UKQ2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ADAM28Q9UKQ2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ADAM28Q9UKQ2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ADAM28Q9UKQ2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ADAM28Q9UKQ2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ADAM28Q9UKQ2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ADAM28Q9UKQ2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ADAM28Q9UKQ2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ADAM28Q9UKQ2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ADAM28Q9UKQ2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ADAM28Q9UKQ2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ADAM28Q9UKQ2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ADAM28Q9UKQ2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ADAM28Q9UKQ2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ADAM28Q9UKQ2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ADAM28Q9UKQ2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ADAM28Q9UKQ2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ADAM28Q9UKQ2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms