Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKN5

PRDM4, PR domain zinc finger protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM4Q9UKN5 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRDM4Q9UKN5 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PRDM4Q9UKN5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRDM4Q9UKN5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRDM4Q9UKN5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRDM4Q9UKN5 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRDM4Q9UKN5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRDM4Q9UKN5 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRDM4Q9UKN5 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRDM4Q9UKN5 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRDM4Q9UKN5 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRDM4Q9UKN5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRDM4Q9UKN5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRDM4Q9UKN5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRDM4Q9UKN5 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRDM4Q9UKN5 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRDM4Q9UKN5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRDM4Q9UKN5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRDM4Q9UKN5 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRDM4Q9UKN5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRDM4Q9UKN5 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRDM4Q9UKN5 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRDM4Q9UKN5 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRDM4Q9UKN5 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PRDM4Q9UKN5 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRDM4Q9UKN5 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRDM4Q9UKN5 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRDM4Q9UKN5 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRDM4Q9UKN5 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRDM4Q9UKN5 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRDM4Q9UKN5 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRDM4Q9UKN5 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRDM4Q9UKN5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRDM4Q9UKN5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRDM4Q9UKN5 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRDM4Q9UKN5 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRDM4Q9UKN5 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRDM4Q9UKN5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRDM4Q9UKN5 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PRDM4Q9UKN5 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRDM4Q9UKN5 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRDM4Q9UKN5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRDM4Q9UKN5 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRDM4Q9UKN5 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRDM4Q9UKN5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRDM4Q9UKN5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRDM4Q9UKN5 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRDM4Q9UKN5 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRDM4Q9UKN5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRDM4Q9UKN5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRDM4Q9UKN5 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRDM4Q9UKN5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRDM4Q9UKN5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRDM4Q9UKN5 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRDM4Q9UKN5 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRDM4Q9UKN5 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRDM4Q9UKN5 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRDM4Q9UKN5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRDM4Q9UKN5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRDM4Q9UKN5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRDM4Q9UKN5 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRDM4Q9UKN5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRDM4Q9UKN5 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRDM4Q9UKN5 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRDM4Q9UKN5 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRDM4Q9UKN5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRDM4Q9UKN5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRDM4Q9UKN5 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRDM4Q9UKN5 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRDM4Q9UKN5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRDM4Q9UKN5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRDM4Q9UKN5 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRDM4Q9UKN5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRDM4Q9UKN5 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRDM4Q9UKN5 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRDM4Q9UKN5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRDM4Q9UKN5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRDM4Q9UKN5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRDM4Q9UKN5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRDM4Q9UKN5 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRDM4Q9UKN5 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRDM4Q9UKN5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRDM4Q9UKN5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRDM4Q9UKN5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRDM4Q9UKN5 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRDM4Q9UKN5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRDM4Q9UKN5 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRDM4Q9UKN5 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRDM4Q9UKN5 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRDM4Q9UKN5 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRDM4Q9UKN5 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRDM4Q9UKN5 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRDM4Q9UKN5 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRDM4Q9UKN5 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRDM4Q9UKN5 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRDM4Q9UKN5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRDM4Q9UKN5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRDM4Q9UKN5 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRDM4Q9UKN5 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRDM4Q9UKN5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms