Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW2

PLXNA1, Plexin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 1,896 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA1Q9UIW2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PLXNA1Q9UIW2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PLXNA1Q9UIW2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PLXNA1Q9UIW2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PLXNA1Q9UIW2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PLXNA1Q9UIW2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PLXNA1Q9UIW2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PLXNA1Q9UIW2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PLXNA1Q9UIW2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PLXNA1Q9UIW2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PLXNA1Q9UIW2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PLXNA1Q9UIW2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PLXNA1Q9UIW2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PLXNA1Q9UIW2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PLXNA1Q9UIW2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PLXNA1Q9UIW2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PLXNA1Q9UIW2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PLXNA1Q9UIW2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PLXNA1Q9UIW2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PLXNA1Q9UIW2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
PLXNA1Q9UIW2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
PLXNA1Q9UIW2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
PLXNA1Q9UIW2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PLXNA1Q9UIW2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PLXNA1Q9UIW2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PLXNA1Q9UIW2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PLXNA1Q9UIW2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PLXNA1Q9UIW2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PLXNA1Q9UIW2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PLXNA1Q9UIW2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PLXNA1Q9UIW2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PLXNA1Q9UIW2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PLXNA1Q9UIW2 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PLXNA1Q9UIW2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PLXNA1Q9UIW2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PLXNA1Q9UIW2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PLXNA1Q9UIW2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PLXNA1Q9UIW2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PLXNA1Q9UIW2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PLXNA1Q9UIW2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PLXNA1Q9UIW2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PLXNA1Q9UIW2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PLXNA1Q9UIW2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PLXNA1Q9UIW2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PLXNA1Q9UIW2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PLXNA1Q9UIW2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PLXNA1Q9UIW2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PLXNA1Q9UIW2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PLXNA1Q9UIW2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PLXNA1Q9UIW2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PLXNA1Q9UIW2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PLXNA1Q9UIW2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PLXNA1Q9UIW2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PLXNA1Q9UIW2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PLXNA1Q9UIW2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PLXNA1Q9UIW2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PLXNA1Q9UIW2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PLXNA1Q9UIW2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PLXNA1Q9UIW2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
PLXNA1Q9UIW2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PLXNA1Q9UIW2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PLXNA1Q9UIW2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PLXNA1Q9UIW2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PLXNA1Q9UIW2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PLXNA1Q9UIW2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PLXNA1Q9UIW2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PLXNA1Q9UIW2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PLXNA1Q9UIW2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PLXNA1Q9UIW2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PLXNA1Q9UIW2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PLXNA1Q9UIW2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PLXNA1Q9UIW2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PLXNA1Q9UIW2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PLXNA1Q9UIW2 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PLXNA1Q9UIW2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PLXNA1Q9UIW2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PLXNA1Q9UIW2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PLXNA1Q9UIW2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PLXNA1Q9UIW2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PLXNA1Q9UIW2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PLXNA1Q9UIW2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PLXNA1Q9UIW2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PLXNA1Q9UIW2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PLXNA1Q9UIW2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PLXNA1Q9UIW2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PLXNA1Q9UIW2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PLXNA1Q9UIW2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PLXNA1Q9UIW2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PLXNA1Q9UIW2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PLXNA1Q9UIW2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PLXNA1Q9UIW2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PLXNA1Q9UIW2 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PLXNA1Q9UIW2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PLXNA1Q9UIW2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PLXNA1Q9UIW2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PLXNA1Q9UIW2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
PLXNA1Q9UIW2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PLXNA1Q9UIW2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PLXNA1Q9UIW2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PLXNA1Q9UIW2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms