Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIK5

TMEFF2, Tomoregulin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEFF2Q9UIK5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEFF2Q9UIK5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEFF2Q9UIK5 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEFF2Q9UIK5 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEFF2Q9UIK5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEFF2Q9UIK5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEFF2Q9UIK5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEFF2Q9UIK5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEFF2Q9UIK5 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEFF2Q9UIK5 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEFF2Q9UIK5 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEFF2Q9UIK5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEFF2Q9UIK5 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TMEFF2Q9UIK5 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TMEFF2Q9UIK5 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEFF2Q9UIK5 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEFF2Q9UIK5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEFF2Q9UIK5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEFF2Q9UIK5 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEFF2Q9UIK5 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEFF2Q9UIK5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEFF2Q9UIK5 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEFF2Q9UIK5 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEFF2Q9UIK5 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEFF2Q9UIK5 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEFF2Q9UIK5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEFF2Q9UIK5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEFF2Q9UIK5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEFF2Q9UIK5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEFF2Q9UIK5 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEFF2Q9UIK5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEFF2Q9UIK5 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEFF2Q9UIK5 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEFF2Q9UIK5 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEFF2Q9UIK5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEFF2Q9UIK5 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEFF2Q9UIK5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEFF2Q9UIK5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEFF2Q9UIK5 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEFF2Q9UIK5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEFF2Q9UIK5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEFF2Q9UIK5 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEFF2Q9UIK5 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEFF2Q9UIK5 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEFF2Q9UIK5 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEFF2Q9UIK5 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEFF2Q9UIK5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEFF2Q9UIK5 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEFF2Q9UIK5 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEFF2Q9UIK5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEFF2Q9UIK5 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEFF2Q9UIK5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEFF2Q9UIK5 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEFF2Q9UIK5 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEFF2Q9UIK5 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEFF2Q9UIK5 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEFF2Q9UIK5 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEFF2Q9UIK5 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEFF2Q9UIK5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEFF2Q9UIK5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEFF2Q9UIK5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEFF2Q9UIK5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEFF2Q9UIK5 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEFF2Q9UIK5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEFF2Q9UIK5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEFF2Q9UIK5 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEFF2Q9UIK5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEFF2Q9UIK5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEFF2Q9UIK5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEFF2Q9UIK5 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMEFF2Q9UIK5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMEFF2Q9UIK5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEFF2Q9UIK5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEFF2Q9UIK5 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEFF2Q9UIK5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEFF2Q9UIK5 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEFF2Q9UIK5 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEFF2Q9UIK5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEFF2Q9UIK5 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEFF2Q9UIK5 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEFF2Q9UIK5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEFF2Q9UIK5 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEFF2Q9UIK5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEFF2Q9UIK5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEFF2Q9UIK5 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEFF2Q9UIK5 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEFF2Q9UIK5 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEFF2Q9UIK5 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEFF2Q9UIK5 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEFF2Q9UIK5 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEFF2Q9UIK5 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEFF2Q9UIK5 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEFF2Q9UIK5 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEFF2Q9UIK5 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEFF2Q9UIK5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEFF2Q9UIK5 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEFF2Q9UIK5 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEFF2Q9UIK5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEFF2Q9UIK5 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEFF2Q9UIK5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms