Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI42

CPA4, Carboxypeptidase A4, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA4Q9UI42 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CPA4Q9UI42 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CPA4Q9UI42 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CPA4Q9UI42 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CPA4Q9UI42 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CPA4Q9UI42 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CPA4Q9UI42 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CPA4Q9UI42 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CPA4Q9UI42 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CPA4Q9UI42 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CPA4Q9UI42 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CPA4Q9UI42 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CPA4Q9UI42 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CPA4Q9UI42 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CPA4Q9UI42 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CPA4Q9UI42 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CPA4Q9UI42 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CPA4Q9UI42 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CPA4Q9UI42 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CPA4Q9UI42 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CPA4Q9UI42 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CPA4Q9UI42 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CPA4Q9UI42 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CPA4Q9UI42 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CPA4Q9UI42 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CPA4Q9UI42 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CPA4Q9UI42 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CPA4Q9UI42 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CPA4Q9UI42 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CPA4Q9UI42 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CPA4Q9UI42 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CPA4Q9UI42 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CPA4Q9UI42 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CPA4Q9UI42 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CPA4Q9UI42 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CPA4Q9UI42 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CPA4Q9UI42 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CPA4Q9UI42 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CPA4Q9UI42 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CPA4Q9UI42 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CPA4Q9UI42 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CPA4Q9UI42 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CPA4Q9UI42 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CPA4Q9UI42 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CPA4Q9UI42 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CPA4Q9UI42 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CPA4Q9UI42 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CPA4Q9UI42 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CPA4Q9UI42 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CPA4Q9UI42 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CPA4Q9UI42 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CPA4Q9UI42 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CPA4Q9UI42 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CPA4Q9UI42 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CPA4Q9UI42 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CPA4Q9UI42 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CPA4Q9UI42 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CPA4Q9UI42 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CPA4Q9UI42 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CPA4Q9UI42 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CPA4Q9UI42 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CPA4Q9UI42 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CPA4Q9UI42 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CPA4Q9UI42 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CPA4Q9UI42 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CPA4Q9UI42 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CPA4Q9UI42 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CPA4Q9UI42 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CPA4Q9UI42 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CPA4Q9UI42 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CPA4Q9UI42 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CPA4Q9UI42 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CPA4Q9UI42 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CPA4Q9UI42 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CPA4Q9UI42 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CPA4Q9UI42 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CPA4Q9UI42 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CPA4Q9UI42 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CPA4Q9UI42 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CPA4Q9UI42 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CPA4Q9UI42 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CPA4Q9UI42 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CPA4Q9UI42 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CPA4Q9UI42 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CPA4Q9UI42 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CPA4Q9UI42 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CPA4Q9UI42 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CPA4Q9UI42 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CPA4Q9UI42 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CPA4Q9UI42 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CPA4Q9UI42 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CPA4Q9UI42 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CPA4Q9UI42 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CPA4Q9UI42 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CPA4Q9UI42 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CPA4Q9UI42 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CPA4Q9UI42 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CPA4Q9UI42 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
CPA4Q9UI42 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CPA4Q9UI42 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms