Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC6

CNTNAP2, Contactin-associated protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CNTNAP2Q9UHC6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CNTNAP2Q9UHC6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CNTNAP2Q9UHC6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CNTNAP2Q9UHC6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CNTNAP2Q9UHC6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CNTNAP2Q9UHC6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CNTNAP2Q9UHC6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CNTNAP2Q9UHC6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CNTNAP2Q9UHC6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNTNAP2Q9UHC6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNTNAP2Q9UHC6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNTNAP2Q9UHC6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNTNAP2Q9UHC6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNTNAP2Q9UHC6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNTNAP2Q9UHC6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNTNAP2Q9UHC6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNTNAP2Q9UHC6 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNTNAP2Q9UHC6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNTNAP2Q9UHC6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNTNAP2Q9UHC6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CNTNAP2Q9UHC6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CNTNAP2Q9UHC6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CNTNAP2Q9UHC6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CNTNAP2Q9UHC6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CNTNAP2Q9UHC6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CNTNAP2Q9UHC6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CNTNAP2Q9UHC6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNTNAP2Q9UHC6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNTNAP2Q9UHC6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNTNAP2Q9UHC6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNTNAP2Q9UHC6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNTNAP2Q9UHC6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNTNAP2Q9UHC6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNTNAP2Q9UHC6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNTNAP2Q9UHC6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNTNAP2Q9UHC6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNTNAP2Q9UHC6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNTNAP2Q9UHC6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNTNAP2Q9UHC6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNTNAP2Q9UHC6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNTNAP2Q9UHC6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNTNAP2Q9UHC6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNTNAP2Q9UHC6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNTNAP2Q9UHC6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNTNAP2Q9UHC6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNTNAP2Q9UHC6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNTNAP2Q9UHC6 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNTNAP2Q9UHC6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNTNAP2Q9UHC6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNTNAP2Q9UHC6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNTNAP2Q9UHC6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNTNAP2Q9UHC6 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNTNAP2Q9UHC6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNTNAP2Q9UHC6 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNTNAP2Q9UHC6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNTNAP2Q9UHC6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNTNAP2Q9UHC6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNTNAP2Q9UHC6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNTNAP2Q9UHC6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNTNAP2Q9UHC6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNTNAP2Q9UHC6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CNTNAP2Q9UHC6 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNTNAP2Q9UHC6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNTNAP2Q9UHC6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNTNAP2Q9UHC6 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CNTNAP2Q9UHC6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNTNAP2Q9UHC6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNTNAP2Q9UHC6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNTNAP2Q9UHC6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CNTNAP2Q9UHC6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNTNAP2Q9UHC6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNTNAP2Q9UHC6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNTNAP2Q9UHC6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNTNAP2Q9UHC6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNTNAP2Q9UHC6 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNTNAP2Q9UHC6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNTNAP2Q9UHC6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNTNAP2Q9UHC6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNTNAP2Q9UHC6 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CNTNAP2Q9UHC6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNTNAP2Q9UHC6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CNTNAP2Q9UHC6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNTNAP2Q9UHC6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNTNAP2Q9UHC6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNTNAP2Q9UHC6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNTNAP2Q9UHC6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNTNAP2Q9UHC6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNTNAP2Q9UHC6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CNTNAP2Q9UHC6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNTNAP2Q9UHC6 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNTNAP2Q9UHC6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNTNAP2Q9UHC6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNTNAP2Q9UHC6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNTNAP2Q9UHC6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNTNAP2Q9UHC6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNTNAP2Q9UHC6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms