Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGC7

MTRF1L, Peptide chain release factor 1-like, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTRF1LQ9UGC7 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MTRF1LQ9UGC7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MTRF1LQ9UGC7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MTRF1LQ9UGC7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MTRF1LQ9UGC7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MTRF1LQ9UGC7 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MTRF1LQ9UGC7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MTRF1LQ9UGC7 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MTRF1LQ9UGC7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MTRF1LQ9UGC7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MTRF1LQ9UGC7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MTRF1LQ9UGC7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MTRF1LQ9UGC7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MTRF1LQ9UGC7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MTRF1LQ9UGC7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MTRF1LQ9UGC7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MTRF1LQ9UGC7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MTRF1LQ9UGC7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MTRF1LQ9UGC7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MTRF1LQ9UGC7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MTRF1LQ9UGC7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MTRF1LQ9UGC7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MTRF1LQ9UGC7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MTRF1LQ9UGC7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTRF1LQ9UGC7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTRF1LQ9UGC7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTRF1LQ9UGC7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTRF1LQ9UGC7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MTRF1LQ9UGC7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
MTRF1LQ9UGC7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MTRF1LQ9UGC7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MTRF1LQ9UGC7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MTRF1LQ9UGC7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MTRF1LQ9UGC7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MTRF1LQ9UGC7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MTRF1LQ9UGC7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MTRF1LQ9UGC7 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MTRF1LQ9UGC7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MTRF1LQ9UGC7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MTRF1LQ9UGC7 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MTRF1LQ9UGC7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MTRF1LQ9UGC7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MTRF1LQ9UGC7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MTRF1LQ9UGC7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MTRF1LQ9UGC7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MTRF1LQ9UGC7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
MTRF1LQ9UGC7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
MTRF1LQ9UGC7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MTRF1LQ9UGC7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MTRF1LQ9UGC7 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MTRF1LQ9UGC7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MTRF1LQ9UGC7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MTRF1LQ9UGC7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MTRF1LQ9UGC7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MTRF1LQ9UGC7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MTRF1LQ9UGC7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MTRF1LQ9UGC7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MTRF1LQ9UGC7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MTRF1LQ9UGC7 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MTRF1LQ9UGC7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MTRF1LQ9UGC7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MTRF1LQ9UGC7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MTRF1LQ9UGC7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MTRF1LQ9UGC7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MTRF1LQ9UGC7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MTRF1LQ9UGC7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MTRF1LQ9UGC7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MTRF1LQ9UGC7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MTRF1LQ9UGC7 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MTRF1LQ9UGC7 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MTRF1LQ9UGC7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MTRF1LQ9UGC7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MTRF1LQ9UGC7 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MTRF1LQ9UGC7 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MTRF1LQ9UGC7 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
MTRF1LQ9UGC7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MTRF1LQ9UGC7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MTRF1LQ9UGC7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MTRF1LQ9UGC7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MTRF1LQ9UGC7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MTRF1LQ9UGC7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MTRF1LQ9UGC7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MTRF1LQ9UGC7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MTRF1LQ9UGC7 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MTRF1LQ9UGC7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MTRF1LQ9UGC7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MTRF1LQ9UGC7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MTRF1LQ9UGC7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MTRF1LQ9UGC7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MTRF1LQ9UGC7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MTRF1LQ9UGC7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
MTRF1LQ9UGC7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MTRF1LQ9UGC7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MTRF1LQ9UGC7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MTRF1LQ9UGC7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MTRF1LQ9UGC7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MTRF1LQ9UGC7 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MTRF1LQ9UGC7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MTRF1LQ9UGC7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MTRF1LQ9UGC7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.9 ms