Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFF9

CNOT8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT8Q9UFF9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CNOT8Q9UFF9 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CNOT8Q9UFF9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNOT8Q9UFF9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNOT8Q9UFF9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNOT8Q9UFF9 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNOT8Q9UFF9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CNOT8Q9UFF9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CNOT8Q9UFF9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CNOT8Q9UFF9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CNOT8Q9UFF9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CNOT8Q9UFF9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CNOT8Q9UFF9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CNOT8Q9UFF9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CNOT8Q9UFF9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CNOT8Q9UFF9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNOT8Q9UFF9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNOT8Q9UFF9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNOT8Q9UFF9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNOT8Q9UFF9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNOT8Q9UFF9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CNOT8Q9UFF9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNOT8Q9UFF9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNOT8Q9UFF9 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNOT8Q9UFF9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNOT8Q9UFF9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNOT8Q9UFF9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNOT8Q9UFF9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNOT8Q9UFF9 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNOT8Q9UFF9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNOT8Q9UFF9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNOT8Q9UFF9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CNOT8Q9UFF9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNOT8Q9UFF9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNOT8Q9UFF9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNOT8Q9UFF9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNOT8Q9UFF9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNOT8Q9UFF9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNOT8Q9UFF9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNOT8Q9UFF9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNOT8Q9UFF9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNOT8Q9UFF9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNOT8Q9UFF9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNOT8Q9UFF9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNOT8Q9UFF9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNOT8Q9UFF9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNOT8Q9UFF9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNOT8Q9UFF9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNOT8Q9UFF9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNOT8Q9UFF9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNOT8Q9UFF9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNOT8Q9UFF9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNOT8Q9UFF9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNOT8Q9UFF9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNOT8Q9UFF9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNOT8Q9UFF9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNOT8Q9UFF9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNOT8Q9UFF9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNOT8Q9UFF9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CNOT8Q9UFF9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNOT8Q9UFF9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNOT8Q9UFF9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CNOT8Q9UFF9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
CNOT8Q9UFF9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CNOT8Q9UFF9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNOT8Q9UFF9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNOT8Q9UFF9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNOT8Q9UFF9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNOT8Q9UFF9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNOT8Q9UFF9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNOT8Q9UFF9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNOT8Q9UFF9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNOT8Q9UFF9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNOT8Q9UFF9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNOT8Q9UFF9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNOT8Q9UFF9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNOT8Q9UFF9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNOT8Q9UFF9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNOT8Q9UFF9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CNOT8Q9UFF9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CNOT8Q9UFF9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNOT8Q9UFF9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNOT8Q9UFF9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CNOT8Q9UFF9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNOT8Q9UFF9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNOT8Q9UFF9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNOT8Q9UFF9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNOT8Q9UFF9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNOT8Q9UFF9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNOT8Q9UFF9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNOT8Q9UFF9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNOT8Q9UFF9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNOT8Q9UFF9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNOT8Q9UFF9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNOT8Q9UFF9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNOT8Q9UFF9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNOT8Q9UFF9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNOT8Q9UFF9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNOT8Q9UFF9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNOT8Q9UFF9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms