Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PPARGC1AQ9UBK2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPARGC1AQ9UBK2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPARGC1AQ9UBK2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPARGC1AQ9UBK2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPARGC1AQ9UBK2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPARGC1AQ9UBK2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPARGC1AQ9UBK2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPARGC1AQ9UBK2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPARGC1AQ9UBK2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPARGC1AQ9UBK2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPARGC1AQ9UBK2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPARGC1AQ9UBK2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPARGC1AQ9UBK2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPARGC1AQ9UBK2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPARGC1AQ9UBK2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPARGC1AQ9UBK2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPARGC1AQ9UBK2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPARGC1AQ9UBK2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPARGC1AQ9UBK2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPARGC1AQ9UBK2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPARGC1AQ9UBK2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPARGC1AQ9UBK2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPARGC1AQ9UBK2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPARGC1AQ9UBK2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPARGC1AQ9UBK2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PPARGC1AQ9UBK2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PPARGC1AQ9UBK2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PPARGC1AQ9UBK2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PPARGC1AQ9UBK2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PPARGC1AQ9UBK2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PPARGC1AQ9UBK2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPARGC1AQ9UBK2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPARGC1AQ9UBK2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPARGC1AQ9UBK2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPARGC1AQ9UBK2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPARGC1AQ9UBK2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPARGC1AQ9UBK2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPARGC1AQ9UBK2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPARGC1AQ9UBK2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPARGC1AQ9UBK2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPARGC1AQ9UBK2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPARGC1AQ9UBK2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPARGC1AQ9UBK2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPARGC1AQ9UBK2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPARGC1AQ9UBK2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPARGC1AQ9UBK2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPARGC1AQ9UBK2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPARGC1AQ9UBK2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPARGC1AQ9UBK2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPARGC1AQ9UBK2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPARGC1AQ9UBK2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPARGC1AQ9UBK2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPARGC1AQ9UBK2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPARGC1AQ9UBK2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPARGC1AQ9UBK2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPARGC1AQ9UBK2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPARGC1AQ9UBK2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPARGC1AQ9UBK2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPARGC1AQ9UBK2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPARGC1AQ9UBK2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPARGC1AQ9UBK2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPARGC1AQ9UBK2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPARGC1AQ9UBK2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PPARGC1AQ9UBK2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPARGC1AQ9UBK2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPARGC1AQ9UBK2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPARGC1AQ9UBK2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPARGC1AQ9UBK2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPARGC1AQ9UBK2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPARGC1AQ9UBK2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PPARGC1AQ9UBK2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPARGC1AQ9UBK2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PPARGC1AQ9UBK2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPARGC1AQ9UBK2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPARGC1AQ9UBK2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPARGC1AQ9UBK2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPARGC1AQ9UBK2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPARGC1AQ9UBK2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPARGC1AQ9UBK2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPARGC1AQ9UBK2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPARGC1AQ9UBK2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPARGC1AQ9UBK2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPARGC1AQ9UBK2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPARGC1AQ9UBK2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPARGC1AQ9UBK2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPARGC1AQ9UBK2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPARGC1AQ9UBK2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPARGC1AQ9UBK2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPARGC1AQ9UBK2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPARGC1AQ9UBK2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPARGC1AQ9UBK2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PPARGC1AQ9UBK2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPARGC1AQ9UBK2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms