Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB6

NCDN, Neurochondrin, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCDNQ9UBB6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCDNQ9UBB6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCDNQ9UBB6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCDNQ9UBB6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCDNQ9UBB6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCDNQ9UBB6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NCDNQ9UBB6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NCDNQ9UBB6 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NCDNQ9UBB6 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NCDNQ9UBB6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
NCDNQ9UBB6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NCDNQ9UBB6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
NCDNQ9UBB6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NCDNQ9UBB6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NCDNQ9UBB6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NCDNQ9UBB6 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NCDNQ9UBB6 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NCDNQ9UBB6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NCDNQ9UBB6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NCDNQ9UBB6 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCDNQ9UBB6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCDNQ9UBB6 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NCDNQ9UBB6 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCDNQ9UBB6 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NCDNQ9UBB6 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NCDNQ9UBB6 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCDNQ9UBB6 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCDNQ9UBB6 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NCDNQ9UBB6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCDNQ9UBB6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCDNQ9UBB6 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCDNQ9UBB6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCDNQ9UBB6 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCDNQ9UBB6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCDNQ9UBB6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCDNQ9UBB6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCDNQ9UBB6 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCDNQ9UBB6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCDNQ9UBB6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCDNQ9UBB6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCDNQ9UBB6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCDNQ9UBB6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCDNQ9UBB6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCDNQ9UBB6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCDNQ9UBB6 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCDNQ9UBB6 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCDNQ9UBB6 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCDNQ9UBB6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCDNQ9UBB6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCDNQ9UBB6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCDNQ9UBB6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCDNQ9UBB6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NCDNQ9UBB6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NCDNQ9UBB6 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NCDNQ9UBB6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NCDNQ9UBB6 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NCDNQ9UBB6 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NCDNQ9UBB6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NCDNQ9UBB6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NCDNQ9UBB6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NCDNQ9UBB6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NCDNQ9UBB6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCDNQ9UBB6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCDNQ9UBB6 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCDNQ9UBB6 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCDNQ9UBB6 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCDNQ9UBB6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NCDNQ9UBB6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCDNQ9UBB6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCDNQ9UBB6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCDNQ9UBB6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCDNQ9UBB6 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCDNQ9UBB6 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCDNQ9UBB6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NCDNQ9UBB6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NCDNQ9UBB6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NCDNQ9UBB6 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NCDNQ9UBB6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NCDNQ9UBB6 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NCDNQ9UBB6 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NCDNQ9UBB6 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NCDNQ9UBB6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NCDNQ9UBB6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NCDNQ9UBB6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NCDNQ9UBB6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NCDNQ9UBB6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NCDNQ9UBB6 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NCDNQ9UBB6 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NCDNQ9UBB6 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NCDNQ9UBB6 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NCDNQ9UBB6 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NCDNQ9UBB6 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NCDNQ9UBB6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NCDNQ9UBB6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NCDNQ9UBB6 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NCDNQ9UBB6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NCDNQ9UBB6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NCDNQ9UBB6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NCDNQ9UBB6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NCDNQ9UBB6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms