Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2W1

PSMC3IP, Homologous-pairing protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMC3IPQ9P2W1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSMC3IPQ9P2W1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSMC3IPQ9P2W1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PSMC3IPQ9P2W1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PSMC3IPQ9P2W1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSMC3IPQ9P2W1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSMC3IPQ9P2W1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSMC3IPQ9P2W1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSMC3IPQ9P2W1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSMC3IPQ9P2W1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSMC3IPQ9P2W1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSMC3IPQ9P2W1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSMC3IPQ9P2W1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSMC3IPQ9P2W1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSMC3IPQ9P2W1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSMC3IPQ9P2W1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSMC3IPQ9P2W1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSMC3IPQ9P2W1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSMC3IPQ9P2W1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSMC3IPQ9P2W1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSMC3IPQ9P2W1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSMC3IPQ9P2W1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSMC3IPQ9P2W1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PSMC3IPQ9P2W1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSMC3IPQ9P2W1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMC3IPQ9P2W1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMC3IPQ9P2W1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMC3IPQ9P2W1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMC3IPQ9P2W1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PSMC3IPQ9P2W1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PSMC3IPQ9P2W1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PSMC3IPQ9P2W1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PSMC3IPQ9P2W1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PSMC3IPQ9P2W1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSMC3IPQ9P2W1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSMC3IPQ9P2W1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSMC3IPQ9P2W1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSMC3IPQ9P2W1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSMC3IPQ9P2W1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSMC3IPQ9P2W1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSMC3IPQ9P2W1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSMC3IPQ9P2W1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSMC3IPQ9P2W1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSMC3IPQ9P2W1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSMC3IPQ9P2W1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSMC3IPQ9P2W1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSMC3IPQ9P2W1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSMC3IPQ9P2W1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSMC3IPQ9P2W1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSMC3IPQ9P2W1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSMC3IPQ9P2W1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSMC3IPQ9P2W1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSMC3IPQ9P2W1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSMC3IPQ9P2W1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSMC3IPQ9P2W1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSMC3IPQ9P2W1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSMC3IPQ9P2W1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSMC3IPQ9P2W1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PSMC3IPQ9P2W1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSMC3IPQ9P2W1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSMC3IPQ9P2W1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSMC3IPQ9P2W1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSMC3IPQ9P2W1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSMC3IPQ9P2W1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSMC3IPQ9P2W1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSMC3IPQ9P2W1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PSMC3IPQ9P2W1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSMC3IPQ9P2W1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PSMC3IPQ9P2W1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSMC3IPQ9P2W1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSMC3IPQ9P2W1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSMC3IPQ9P2W1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSMC3IPQ9P2W1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSMC3IPQ9P2W1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSMC3IPQ9P2W1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSMC3IPQ9P2W1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSMC3IPQ9P2W1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSMC3IPQ9P2W1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSMC3IPQ9P2W1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSMC3IPQ9P2W1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSMC3IPQ9P2W1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSMC3IPQ9P2W1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSMC3IPQ9P2W1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSMC3IPQ9P2W1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSMC3IPQ9P2W1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSMC3IPQ9P2W1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSMC3IPQ9P2W1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSMC3IPQ9P2W1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSMC3IPQ9P2W1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSMC3IPQ9P2W1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSMC3IPQ9P2W1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSMC3IPQ9P2W1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSMC3IPQ9P2W1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSMC3IPQ9P2W1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSMC3IPQ9P2W1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSMC3IPQ9P2W1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSMC3IPQ9P2W1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSMC3IPQ9P2W1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSMC3IPQ9P2W1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSMC3IPQ9P2W1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms