Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2M7

CGN, Cingulin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNQ9P2M7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CGNQ9P2M7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CGNQ9P2M7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CGNQ9P2M7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CGNQ9P2M7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CGNQ9P2M7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CGNQ9P2M7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CGNQ9P2M7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CGNQ9P2M7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CGNQ9P2M7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CGNQ9P2M7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CGNQ9P2M7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CGNQ9P2M7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CGNQ9P2M7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CGNQ9P2M7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CGNQ9P2M7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CGNQ9P2M7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CGNQ9P2M7 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CGNQ9P2M7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CGNQ9P2M7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CGNQ9P2M7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CGNQ9P2M7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CGNQ9P2M7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CGNQ9P2M7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CGNQ9P2M7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CGNQ9P2M7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CGNQ9P2M7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CGNQ9P2M7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CGNQ9P2M7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CGNQ9P2M7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CGNQ9P2M7 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CGNQ9P2M7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CGNQ9P2M7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CGNQ9P2M7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CGNQ9P2M7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CGNQ9P2M7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CGNQ9P2M7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CGNQ9P2M7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CGNQ9P2M7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CGNQ9P2M7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CGNQ9P2M7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CGNQ9P2M7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CGNQ9P2M7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CGNQ9P2M7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CGNQ9P2M7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CGNQ9P2M7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CGNQ9P2M7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CGNQ9P2M7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CGNQ9P2M7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CGNQ9P2M7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CGNQ9P2M7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CGNQ9P2M7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CGNQ9P2M7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CGNQ9P2M7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CGNQ9P2M7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CGNQ9P2M7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CGNQ9P2M7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CGNQ9P2M7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CGNQ9P2M7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CGNQ9P2M7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CGNQ9P2M7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CGNQ9P2M7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CGNQ9P2M7 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CGNQ9P2M7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CGNQ9P2M7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CGNQ9P2M7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CGNQ9P2M7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CGNQ9P2M7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CGNQ9P2M7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CGNQ9P2M7 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CGNQ9P2M7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CGNQ9P2M7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CGNQ9P2M7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CGNQ9P2M7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CGNQ9P2M7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CGNQ9P2M7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CGNQ9P2M7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CGNQ9P2M7 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CGNQ9P2M7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CGNQ9P2M7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CGNQ9P2M7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CGNQ9P2M7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CGNQ9P2M7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CGNQ9P2M7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CGNQ9P2M7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CGNQ9P2M7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CGNQ9P2M7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CGNQ9P2M7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CGNQ9P2M7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CGNQ9P2M7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CGNQ9P2M7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CGNQ9P2M7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CGNQ9P2M7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CGNQ9P2M7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CGNQ9P2M7 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CGNQ9P2M7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CGNQ9P2M7 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CGNQ9P2M7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CGNQ9P2M7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CGNQ9P2M7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms