Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2B2

PTGFRN, Prostaglandin F2 receptor negative regulator, humanhuman

Predictions only

Length 879 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGFRNQ9P2B2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTGFRNQ9P2B2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTGFRNQ9P2B2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTGFRNQ9P2B2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTGFRNQ9P2B2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTGFRNQ9P2B2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTGFRNQ9P2B2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTGFRNQ9P2B2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTGFRNQ9P2B2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTGFRNQ9P2B2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTGFRNQ9P2B2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTGFRNQ9P2B2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTGFRNQ9P2B2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTGFRNQ9P2B2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTGFRNQ9P2B2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTGFRNQ9P2B2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTGFRNQ9P2B2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTGFRNQ9P2B2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTGFRNQ9P2B2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTGFRNQ9P2B2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTGFRNQ9P2B2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTGFRNQ9P2B2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTGFRNQ9P2B2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTGFRNQ9P2B2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTGFRNQ9P2B2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTGFRNQ9P2B2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTGFRNQ9P2B2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTGFRNQ9P2B2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTGFRNQ9P2B2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTGFRNQ9P2B2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTGFRNQ9P2B2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTGFRNQ9P2B2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTGFRNQ9P2B2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTGFRNQ9P2B2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTGFRNQ9P2B2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTGFRNQ9P2B2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTGFRNQ9P2B2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTGFRNQ9P2B2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTGFRNQ9P2B2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTGFRNQ9P2B2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTGFRNQ9P2B2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTGFRNQ9P2B2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTGFRNQ9P2B2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTGFRNQ9P2B2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTGFRNQ9P2B2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTGFRNQ9P2B2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTGFRNQ9P2B2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTGFRNQ9P2B2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PTGFRNQ9P2B2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTGFRNQ9P2B2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTGFRNQ9P2B2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTGFRNQ9P2B2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTGFRNQ9P2B2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTGFRNQ9P2B2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTGFRNQ9P2B2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTGFRNQ9P2B2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTGFRNQ9P2B2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTGFRNQ9P2B2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTGFRNQ9P2B2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTGFRNQ9P2B2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTGFRNQ9P2B2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTGFRNQ9P2B2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PTGFRNQ9P2B2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTGFRNQ9P2B2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTGFRNQ9P2B2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTGFRNQ9P2B2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTGFRNQ9P2B2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTGFRNQ9P2B2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTGFRNQ9P2B2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTGFRNQ9P2B2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTGFRNQ9P2B2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTGFRNQ9P2B2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTGFRNQ9P2B2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTGFRNQ9P2B2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTGFRNQ9P2B2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTGFRNQ9P2B2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTGFRNQ9P2B2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTGFRNQ9P2B2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTGFRNQ9P2B2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PTGFRNQ9P2B2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTGFRNQ9P2B2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTGFRNQ9P2B2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTGFRNQ9P2B2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTGFRNQ9P2B2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTGFRNQ9P2B2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTGFRNQ9P2B2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTGFRNQ9P2B2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTGFRNQ9P2B2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTGFRNQ9P2B2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTGFRNQ9P2B2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTGFRNQ9P2B2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTGFRNQ9P2B2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTGFRNQ9P2B2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTGFRNQ9P2B2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTGFRNQ9P2B2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTGFRNQ9P2B2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTGFRNQ9P2B2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PTGFRNQ9P2B2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTGFRNQ9P2B2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTGFRNQ9P2B2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms