Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNTN3Q9P232 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNTN3Q9P232 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNTN3Q9P232 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNTN3Q9P232 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNTN3Q9P232 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNTN3Q9P232 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNTN3Q9P232 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNTN3Q9P232 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNTN3Q9P232 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CNTN3Q9P232 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNTN3Q9P232 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CNTN3Q9P232 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CNTN3Q9P232 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNTN3Q9P232 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNTN3Q9P232 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNTN3Q9P232 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNTN3Q9P232 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNTN3Q9P232 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CNTN3Q9P232 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNTN3Q9P232 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNTN3Q9P232 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CNTN3Q9P232 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CNTN3Q9P232 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CNTN3Q9P232 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CNTN3Q9P232 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNTN3Q9P232 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNTN3Q9P232 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNTN3Q9P232 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNTN3Q9P232 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNTN3Q9P232 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNTN3Q9P232 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CNTN3Q9P232 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNTN3Q9P232 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNTN3Q9P232 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNTN3Q9P232 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNTN3Q9P232 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNTN3Q9P232 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNTN3Q9P232 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNTN3Q9P232 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNTN3Q9P232 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNTN3Q9P232 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNTN3Q9P232 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNTN3Q9P232 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNTN3Q9P232 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNTN3Q9P232 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CNTN3Q9P232 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNTN3Q9P232 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNTN3Q9P232 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNTN3Q9P232 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNTN3Q9P232 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNTN3Q9P232 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CNTN3Q9P232 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNTN3Q9P232 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNTN3Q9P232 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNTN3Q9P232 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNTN3Q9P232 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNTN3Q9P232 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNTN3Q9P232 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNTN3Q9P232 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNTN3Q9P232 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNTN3Q9P232 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNTN3Q9P232 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNTN3Q9P232 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CNTN3Q9P232 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNTN3Q9P232 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNTN3Q9P232 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNTN3Q9P232 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNTN3Q9P232 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNTN3Q9P232 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNTN3Q9P232 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNTN3Q9P232 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNTN3Q9P232 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNTN3Q9P232 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNTN3Q9P232 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNTN3Q9P232 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNTN3Q9P232 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNTN3Q9P232 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNTN3Q9P232 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CNTN3Q9P232 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNTN3Q9P232 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNTN3Q9P232 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNTN3Q9P232 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNTN3Q9P232 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNTN3Q9P232 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNTN3Q9P232 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNTN3Q9P232 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNTN3Q9P232 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNTN3Q9P232 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CNTN3Q9P232 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNTN3Q9P232 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNTN3Q9P232 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNTN3Q9P232 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CNTN3Q9P232 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNTN3Q9P232 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNTN3Q9P232 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNTN3Q9P232 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNTN3Q9P232 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNTN3Q9P232 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNTN3Q9P232 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms