Protein–RNA interactions for Protein: Q9P217

ZSWIM5, Zinc finger SWIM domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZSWIM5Q9P217 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZSWIM5Q9P217 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZSWIM5Q9P217 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZSWIM5Q9P217 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZSWIM5Q9P217 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZSWIM5Q9P217 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZSWIM5Q9P217 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZSWIM5Q9P217 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZSWIM5Q9P217 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZSWIM5Q9P217 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZSWIM5Q9P217 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZSWIM5Q9P217 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZSWIM5Q9P217 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZSWIM5Q9P217 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZSWIM5Q9P217 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ZSWIM5Q9P217 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
ZSWIM5Q9P217 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ZSWIM5Q9P217 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZSWIM5Q9P217 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZSWIM5Q9P217 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZSWIM5Q9P217 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZSWIM5Q9P217 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZSWIM5Q9P217 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZSWIM5Q9P217 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZSWIM5Q9P217 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZSWIM5Q9P217 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZSWIM5Q9P217 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZSWIM5Q9P217 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
ZSWIM5Q9P217 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
ZSWIM5Q9P217 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZSWIM5Q9P217 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZSWIM5Q9P217 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZSWIM5Q9P217 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZSWIM5Q9P217 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZSWIM5Q9P217 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZSWIM5Q9P217 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZSWIM5Q9P217 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZSWIM5Q9P217 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZSWIM5Q9P217 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZSWIM5Q9P217 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZSWIM5Q9P217 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZSWIM5Q9P217 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZSWIM5Q9P217 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZSWIM5Q9P217 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZSWIM5Q9P217 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZSWIM5Q9P217 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZSWIM5Q9P217 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZSWIM5Q9P217 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
ZSWIM5Q9P217 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZSWIM5Q9P217 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZSWIM5Q9P217 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZSWIM5Q9P217 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
ZSWIM5Q9P217 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZSWIM5Q9P217 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZSWIM5Q9P217 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZSWIM5Q9P217 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
ZSWIM5Q9P217 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZSWIM5Q9P217 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZSWIM5Q9P217 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZSWIM5Q9P217 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZSWIM5Q9P217 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZSWIM5Q9P217 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZSWIM5Q9P217 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZSWIM5Q9P217 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZSWIM5Q9P217 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
ZSWIM5Q9P217 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
ZSWIM5Q9P217 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZSWIM5Q9P217 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZSWIM5Q9P217 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZSWIM5Q9P217 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
ZSWIM5Q9P217 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZSWIM5Q9P217 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZSWIM5Q9P217 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
ZSWIM5Q9P217 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
ZSWIM5Q9P217 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZSWIM5Q9P217 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZSWIM5Q9P217 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZSWIM5Q9P217 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZSWIM5Q9P217 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZSWIM5Q9P217 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZSWIM5Q9P217 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZSWIM5Q9P217 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZSWIM5Q9P217 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZSWIM5Q9P217 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZSWIM5Q9P217 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZSWIM5Q9P217 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZSWIM5Q9P217 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZSWIM5Q9P217 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZSWIM5Q9P217 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZSWIM5Q9P217 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZSWIM5Q9P217 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZSWIM5Q9P217 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ZSWIM5Q9P217 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ZSWIM5Q9P217 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ZSWIM5Q9P217 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
ZSWIM5Q9P217 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ZSWIM5Q9P217 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ZSWIM5Q9P217 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ZSWIM5Q9P217 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ZSWIM5Q9P217 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms