Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z2

CALCOCO1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO1Q9P1Z2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CALCOCO1Q9P1Z2 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CALCOCO1Q9P1Z2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CALCOCO1Q9P1Z2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CALCOCO1Q9P1Z2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CALCOCO1Q9P1Z2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CALCOCO1Q9P1Z2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CALCOCO1Q9P1Z2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CALCOCO1Q9P1Z2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CALCOCO1Q9P1Z2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CALCOCO1Q9P1Z2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CALCOCO1Q9P1Z2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CALCOCO1Q9P1Z2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CALCOCO1Q9P1Z2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CALCOCO1Q9P1Z2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CALCOCO1Q9P1Z2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CALCOCO1Q9P1Z2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CALCOCO1Q9P1Z2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CALCOCO1Q9P1Z2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CALCOCO1Q9P1Z2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CALCOCO1Q9P1Z2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CALCOCO1Q9P1Z2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CALCOCO1Q9P1Z2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CALCOCO1Q9P1Z2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CALCOCO1Q9P1Z2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CALCOCO1Q9P1Z2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CALCOCO1Q9P1Z2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CALCOCO1Q9P1Z2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CALCOCO1Q9P1Z2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CALCOCO1Q9P1Z2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CALCOCO1Q9P1Z2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CALCOCO1Q9P1Z2 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CALCOCO1Q9P1Z2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CALCOCO1Q9P1Z2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CALCOCO1Q9P1Z2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CALCOCO1Q9P1Z2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CALCOCO1Q9P1Z2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CALCOCO1Q9P1Z2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CALCOCO1Q9P1Z2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CALCOCO1Q9P1Z2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CALCOCO1Q9P1Z2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CALCOCO1Q9P1Z2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CALCOCO1Q9P1Z2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CALCOCO1Q9P1Z2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CALCOCO1Q9P1Z2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CALCOCO1Q9P1Z2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CALCOCO1Q9P1Z2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CALCOCO1Q9P1Z2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CALCOCO1Q9P1Z2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CALCOCO1Q9P1Z2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CALCOCO1Q9P1Z2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CALCOCO1Q9P1Z2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CALCOCO1Q9P1Z2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CALCOCO1Q9P1Z2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CALCOCO1Q9P1Z2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CALCOCO1Q9P1Z2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CALCOCO1Q9P1Z2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CALCOCO1Q9P1Z2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CALCOCO1Q9P1Z2 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CALCOCO1Q9P1Z2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CALCOCO1Q9P1Z2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CALCOCO1Q9P1Z2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CALCOCO1Q9P1Z2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CALCOCO1Q9P1Z2 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CALCOCO1Q9P1Z2 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CALCOCO1Q9P1Z2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CALCOCO1Q9P1Z2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CALCOCO1Q9P1Z2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CALCOCO1Q9P1Z2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CALCOCO1Q9P1Z2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CALCOCO1Q9P1Z2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CALCOCO1Q9P1Z2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CALCOCO1Q9P1Z2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CALCOCO1Q9P1Z2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CALCOCO1Q9P1Z2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CALCOCO1Q9P1Z2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CALCOCO1Q9P1Z2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CALCOCO1Q9P1Z2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CALCOCO1Q9P1Z2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CALCOCO1Q9P1Z2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CALCOCO1Q9P1Z2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CALCOCO1Q9P1Z2 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CALCOCO1Q9P1Z2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CALCOCO1Q9P1Z2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CALCOCO1Q9P1Z2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CALCOCO1Q9P1Z2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CALCOCO1Q9P1Z2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CALCOCO1Q9P1Z2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CALCOCO1Q9P1Z2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CALCOCO1Q9P1Z2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CALCOCO1Q9P1Z2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CALCOCO1Q9P1Z2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CALCOCO1Q9P1Z2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CALCOCO1Q9P1Z2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms