Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0U4

CXXC1, CXXC-type zinc finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXXC1Q9P0U4 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CXXC1Q9P0U4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CXXC1Q9P0U4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CXXC1Q9P0U4 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CXXC1Q9P0U4 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CXXC1Q9P0U4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CXXC1Q9P0U4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CXXC1Q9P0U4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CXXC1Q9P0U4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CXXC1Q9P0U4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CXXC1Q9P0U4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CXXC1Q9P0U4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CXXC1Q9P0U4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CXXC1Q9P0U4 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CXXC1Q9P0U4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CXXC1Q9P0U4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CXXC1Q9P0U4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CXXC1Q9P0U4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CXXC1Q9P0U4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CXXC1Q9P0U4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CXXC1Q9P0U4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CXXC1Q9P0U4 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CXXC1Q9P0U4 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CXXC1Q9P0U4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CXXC1Q9P0U4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CXXC1Q9P0U4 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CXXC1Q9P0U4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CXXC1Q9P0U4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CXXC1Q9P0U4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CXXC1Q9P0U4 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CXXC1Q9P0U4 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CXXC1Q9P0U4 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CXXC1Q9P0U4 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CXXC1Q9P0U4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CXXC1Q9P0U4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CXXC1Q9P0U4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CXXC1Q9P0U4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CXXC1Q9P0U4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CXXC1Q9P0U4 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CXXC1Q9P0U4 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CXXC1Q9P0U4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CXXC1Q9P0U4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CXXC1Q9P0U4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CXXC1Q9P0U4 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CXXC1Q9P0U4 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CXXC1Q9P0U4 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CXXC1Q9P0U4 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CXXC1Q9P0U4 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CXXC1Q9P0U4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CXXC1Q9P0U4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CXXC1Q9P0U4 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CXXC1Q9P0U4 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CXXC1Q9P0U4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CXXC1Q9P0U4 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CXXC1Q9P0U4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CXXC1Q9P0U4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CXXC1Q9P0U4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CXXC1Q9P0U4 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CXXC1Q9P0U4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CXXC1Q9P0U4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CXXC1Q9P0U4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CXXC1Q9P0U4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CXXC1Q9P0U4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CXXC1Q9P0U4 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CXXC1Q9P0U4 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CXXC1Q9P0U4 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CXXC1Q9P0U4 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CXXC1Q9P0U4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CXXC1Q9P0U4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CXXC1Q9P0U4 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CXXC1Q9P0U4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CXXC1Q9P0U4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CXXC1Q9P0U4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CXXC1Q9P0U4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CXXC1Q9P0U4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CXXC1Q9P0U4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CXXC1Q9P0U4 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CXXC1Q9P0U4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CXXC1Q9P0U4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CXXC1Q9P0U4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CXXC1Q9P0U4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CXXC1Q9P0U4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CXXC1Q9P0U4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CXXC1Q9P0U4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CXXC1Q9P0U4 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CXXC1Q9P0U4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CXXC1Q9P0U4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CXXC1Q9P0U4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CXXC1Q9P0U4 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CXXC1Q9P0U4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CXXC1Q9P0U4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CXXC1Q9P0U4 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CXXC1Q9P0U4 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CXXC1Q9P0U4 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CXXC1Q9P0U4 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CXXC1Q9P0U4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CXXC1Q9P0U4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CXXC1Q9P0U4 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CXXC1Q9P0U4 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CXXC1Q9P0U4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms